PRJNA1358538：人PBMCs对Leptospira感染宿主反应的多组学分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1358538

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究对急性钩端螺旋体病期间的人类宿主反应进行了全面的多组学分析。我们对临床确诊的钩端螺旋体病患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMC）进行了整合的转录组学和蛋白质组学分析。我们的分析揭示了宿主通路的广泛失调，包括TNF-alpha/NF-kappaB信号传导、干扰素反应以及炎症和免疫代谢通路的强烈激活。我们鉴定出一个保守的核心宿主反应特征，在离体全血感染模型中验证了关键免疫介质，并确定了一个与该疾病相关的多蛋白特征。该数据集为理解钩端螺旋体病中宿主-病原体相互作用的分子机制提供了宝贵的资源，并识别出潜在的生物标志物和治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。