PRJNA1314612：儿童allo-HCT受者接受粪菌移植治疗激素难治性GvHD
该数据集来自NCBI，包含健康供者及一名因异基因造血细胞移植后激素难治性移植物抗宿主病而接受粪菌移植的儿童患者的shotgun宏基因组测序数据
基本信息
资源简介
PRJNA1314612：儿童allo-HCT受者接受粪菌移植治疗激素难治性GvHD
PRJNA1314612 数据集来自 NCBI，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads），收录于本站“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”分类下。该数据集包含健康供者以及一名儿童患者的 shotgun 宏基因组测序数据，这名患儿在接受异基因造血细胞移植后出现激素难治性移植物抗宿主病，并因此接受了粪菌移植治疗。研究围绕粪菌移植前后肠道微生物多样性与代谢功能的变化展开，通过在多个时间点采集粪便样本，刻画肠道微生物组组成的恢复情况，并评估粪菌移植在儿童难治性移植物抗宿主病管理中的临床效果。这一病例研究有助于理解针对儿童移植相关并发症的微生物组治疗思路。
【数据集背景】
异基因造血细胞移植是治疗多种血液系统疾病的重要手段，但移植后移植物抗宿主病是常见且严重的并发症，其中激素难治性移植物抗宿主病的处理尤为棘手。粪菌移植作为一种基于肠道微生物组的干预策略，近年来被探索用于移植相关并发症的管理。该数据集正是围绕这一临床背景产生：一名儿童患者在接受异基因造血细胞移植后发生激素难治性移植物抗宿主病，并接受了粪菌移植治疗，研究对其肠道微生物组进行追踪，以观察治疗过程中的微生物学变化与临床反应。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 shotgun 宏基因组测序数据，测序对象包括健康供者和上述儿童患者。数据以原始测序读段的形式提供，主题标签为 Raw sequence reads。研究关注的重点包括肠道微生物多样性的变化以及代谢功能的变化，覆盖粪菌移植治疗之前、治疗期间和治疗之后三个阶段的多个时间点。通过多时间点粪便样本的测序，数据集可用于刻画肠道微生物组组成的恢复过程，并为评估粪菌移植在儿童难治性移植物抗宿主病中的临床效果提供微生物学层面的数据基础。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）。样本为粪便样本，采集自健康供者以及一名接受粪菌移植的儿童患者，采集时间覆盖粪菌移植前、中、后的多个时间点。测序策略为 shotgun 宏基因组测序，产出数据为原始序列读段。关于样本采集的具体流程、测序平台型号、文库构建方法、样本数量及时间点数目等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肠道微生物组与造血细胞移植相关并发症研究方向的使用，例如分析粪菌移植前后肠道微生物多样性的动态变化、考察微生物代谢功能的改变、研究微生物组组成的恢复过程，以及探讨微生物组干预与儿童激素难治性移植物抗宿主病临床转归之间的关系。由于数据同时包含健康供者与患者样本，也可用于供者与受者微生物组特征的比较分析。此外，该数据可作为微生物组治疗方法在儿童移植并发症中应用的案例数据，用于相关方法学讨论与假设生成。
【使用方法】
使用者可基于原始测序读段开展宏基因组分析，常见流程包括读段质量控制、去除低质量序列与宿主序列、物种组成与多样性分析、功能与代谢通路注释等，并结合样本的多时间点信息比较粪菌移植前、中、后的差异。分析时应将健康供者样本与患者样本分别标识，以便进行供受者比较和纵向变化分析。关于具体的分析参数、参考数据库版本及推荐流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为病例研究性质，仅涉及一名儿童患者及健康供者，样本规模有限，结果的外推需谨慎。数据以原始测序读段形式提供，未提供处理后数据或分析结果。关于测序深度、数据量、样本重复数、临床元数据完整程度以及潜在批次效应等信息，源站未提供。使用者应在分析中自行评估数据质量并说明相关局限。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，使用时应遵循源站的引用规范与数据使用政策。关于具体的文献引用信息、作者列表、发表刊物以及许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1314612
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自健康供者以及一名儿科患者的鸟枪法宏基因组测序数据，该患者因异基因造血细胞移植后发生类固醇难治性移植物抗宿主病（GvHD）而接受了粪菌移植（FMT）治疗。该研究追踪了FMT治疗前、治疗期间及治疗后排肠道微生物多样性和代谢功能的变化。在多个时间点采集粪便样本，以表征肠道微生物组组成的恢复情况，并评估FMT在管理儿科人群难治性GvHD中的临床疗效。该病例研究有助于理解针对儿童移植相关并发症的基于微生物组的治疗策略。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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