PRJNA1160415:芒果苷通过调节肠道菌群改善大鼠多囊卵巢综合征

该数据集包含来自无特定病原体SD雌性大鼠粪便样本的原始16S rDNA测序数据,用于研究多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型中的肠道菌群组成

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1160415: Mangiferin Ameliorates Polycystic Ovary Syndrome in Rats by Modulating Gut Microbiota

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1160415:芒果苷通过调节肠道菌群改善大鼠多囊卵巢综合征

该数据集包含来自无特定病原体SD雌性大鼠粪便样本的原始16S rDNA测序数据,用于研究多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型中的肠道菌群组成。样本取自经来曲唑(LET)联合高脂饮食(HFD)诱导PCOS的大鼠,采用标准无菌技术采集,使用QIAamp DNA Stool Mini Kit提取DNA,以341F-806R引物扩增16S rRNA基因V3-V4区,并在Illumina MiSeq平台测序。该数据可用于微生物多样性分析,并支持探究芒果苷干预后肠道菌群、胰岛素抵抗与卵巢细胞凋亡之间关系的研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含从无特定病原体SD雌性大鼠粪便样本中获得的原始16S rDNA测序数据,用于研究多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型中的肠道菌群组成。样本取自经来曲唑(LET)联合高脂饮食(HFD)诱导PCOS的大鼠,并采用标准无菌技术获得。按照制造商说明,使用QIAamp DNA Stool Mini Kit进行DNA提取。使用引物对341F-806R扩增16S rRNA基因的V3-V4区,并在Illumina MiSeq平台上对文库进行测序。该数据集是一项更大研究的一部分,该研究探讨芒果苷干预后PCOS大鼠肠道菌群、胰岛素抵抗与卵巢细胞凋亡之间的关系。序列数据可用于微生物多样性

【主题与分类】

主题标签:Raw sequence reads。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1160415

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含从无特定病原体SD雌性大鼠粪便样本中获取的原始16S rDNA测序数据,这些大鼠用于研究多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型中的肠道微生物组成。样本采集自通过来曲唑(LET)联合高脂饮食(HFD)诱导PCOS的大鼠,并采用标准无菌技术获取。DNA提取使用QIAamp DNA Stool Mini Kit,按照制造商说明进行。16S rRNA基因的V3-V4区域使用引物对341F-806R扩增,文库在Illumina MiSeq平台上测序。该数据集是一项更大研究的一部分,该研究探讨了芒果苷干预后PCOS大鼠肠道微生物群、胰岛素抵抗和卵巢细胞凋亡之间的关系。这些序列数据可用于微生物多样性分析、分类学分类以及理解与PCOS相关的微生物群失调。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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