产前应激子代大鼠海马磷酸化蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD019117

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

产前应激（PS）可能导致子代抑郁。本研究采用LC-MS/MS对PS-S组和CON组子代大鼠海马进行相对定量磷酸化蛋白质组学分析，以验证已知通路并识别抑郁的新领域。共检测到6，790个磷酸肽、9，817个磷酸化位点和2，978个磷酸化蛋白质。在2，978个磷酸化蛋白质中，1，760个（59.09%）具有两个以上磷酸化位点，ENSRNOP00000023460蛋白质具有超过117个磷酸化位点，每100个氨基酸的修饰位点平均分布为2.97个。与CON组子代大鼠相比，PS-S组子代大鼠有197个差异磷酸肽，其中140个磷酸肽增加，57个磷酸肽减少。这些差异磷酸肽分别对应100个上调磷酸化蛋白质和44个下调磷酸化蛋白质。GO富集分析显示，这些差异磷酸化蛋白质在CC类别、MF类别和BP类别的前五个富集条目中共涉及35个不同的磷酸化蛋白质，这些磷酸化蛋白质主要与髓鞘、微管和突触相关蛋白有关。

KEGG通路富集分析的前五个通路涉及许多重要的生物学通路，前五个通路包括安非他命成瘾、胰岛素分泌、库欣综合征和昼夜节律同步信号通路。这前五个通路与九种蛋白相关，包括Adcy9、Apc、Cacna1c、Camk2a、Camk2b、Camk2g、Ctnnd2、Grin2a、Stx1a。需要进一步研究以了解这些通路在PS所致子代大鼠抑郁样行为中的确切作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。