MGYS00006747：动物园哺乳动物101份粪便样本的16S微生物组序列

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/metagenomics/studies/MGYS00006747

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中，我们将哺乳动物肠道微生物组的分类组成和代谢内容作为了解生态系统功能的直接窗口，使用16S扩增子测序和非靶向代谢组学平台分析了来自多种哺乳动物物种的101份粪便样本。我们发现，哺乳动物代谢组具有化学多样性，并与微生物组组成密切相关，而且代谢组组成还与哺乳动物宿主的系统发育相关。在不同动物物种中富集的特定代谢物与宿主-微生物界面有关，包括经过修饰和降解的宿主及膳食化合物。我们的结果表明，微生物分类组成的差异确实转化为宿主特异性代谢，这表明分类学上相距较远的微生物组在功能上更具多样性，而非冗余。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。