炎症性关节炎irAE可能代表一种主要由T细胞驱动但可能非自身抗体驱动的独特自身免疫病
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦炎症性关节炎(IA)免疫相关不良事件(irAE)的免疫发病机制。研究对外周血进行免疫表型分析,比较 IA-irAE 患者与血清阴性类风湿关节炎(RA)患者、未发生 irAE 的 ICI 治疗患者及健康对照

基本信息
资源简介
炎症性关节炎irAE可能代表一种主要由T细胞驱动但可能非自身抗体驱动的独特自身免疫病
Inflammatory arthritis irAE may represent a unique autoimmune disease primarily driven by T cells, but likely not autoantibodies
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦炎症性关节炎(IA)免疫相关不良事件(irAE)的免疫发病机制。研究对外周血进行免疫表型分析,比较 IA-irAE 患者与血清阴性类风湿关节炎(RA)患者、未发生 irAE 的 ICI 治疗患者及健康对照。数据涵盖 T 细胞细胞毒性基因表达与代谢活化增强、CD4⁺ T 细胞 CXCR3 和 CCR6 表达降低,以及 IL-6、IL-12 和 I 型 IFN 升高。可用于探索 IA-irAE 与 RA 的免疫差异及分型研究(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):炎症性关节炎(IA)免疫相关不良事件(irAE)的潜在免疫发病机制仍不清楚。与自身抗体和 B 细胞功能障碍为核心特征的类风湿关节炎(RA)不同,体液免疫对 IA-irAE 的贡献尚不明确。在此,我们对 IA-irAE 患者的外周血进行了免疫表型分析,并将其与血清阴性 RA 患者、未发生 irAE 的 ICI 治疗患者以及健康对照进行比较。IA-irAE 的特征是 T 细胞中细胞毒性基因表达增加和代谢活化,以及 CD4⁺ T 细胞中 CXCR3 和 CCR6 表达降低。与血清阴性 RA 相反,IA-irAE 患者的自身抗体水平或非典型 CD11c⁺CD21⁻ B 细胞没有显著升高。IA-irAE 的进一步特征是 IL-6、IL-12 和 I 型 IFN 水平升高,这与 T 细胞活化表型相关。A
【主题与分类】
主题标签:Humoral immunity、immune checkpoint、Inflammatory arthritis。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A236ba5bdc8f351fd3f74ff093c2c0bbae6261429a412905da468430140283408
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- OpenDataLab:
数据说明
炎症性关节炎(IA)免疫相关不良事件(irAE)的潜在免疫发病机制仍不清楚。与类风湿关节炎(RA)以自身抗体和B细胞功能障碍为核心特征不同,体液免疫对IA-irAE的贡献尚不明确。在此,我们对IA-irAE患者的外周血进行了免疫表型分析,并将其与血清阴性RA患者、接受ICI治疗但未发生irAE的患者以及健康对照进行比较。IA-irAE的特征是T细胞中细胞毒性基因表达增加和代谢活化增强,以及CD4⺠T细胞中CXCR3和CCR6表达降低。与血清阴性RA相反,IA-irAE患者的自身抗体水平或非典型CD11câºCD21â» B细胞未见显著升高。IA-irAE的进一步特征在于IL-6、IL-12和I型IFN水平升高,且与T细胞活化表型相关。总之,我们的研究结果将IA-irAE定义为一种具有某些区别于RA的免疫学特征的疾病……在本研究中,所有患者均获得了明确知情同意,且仅在患者同意参与研究后才采集样本。
同时,我们对所有患者仅使用本组命名研究ID,因此数据均已去标识化。,,# 数据来源:炎症性关节炎irAE可能代表一种主要由T细胞驱动、但很可能并非由自身抗体驱动的独特自身免疫病 数据集DOI:10.5061/dryad.fxpnvx167 ## 数据和文件结构说明 我们使用PBMC对4组患者(HC、RAC、irAE和ICI)进行了单细胞测序。展示了UMAP、前100个TCR克隆以及每个个体的前20个基因。我们还纳入了每个簇的基因标记以及每种细胞类型中的细胞计数。 ### 文件和变量 #### 文件:Auxiliary_Data_3_heatmap_from_scRNAseq_analysis.jpg 说明: 来自scRNAseq分析的每种细胞类型的基因表达热图。 #### 文件
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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