PhIP-Seq鉴定单基因自身免疫综合征APS1中新型临床相关自身抗原

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A7d1a10285158f779da45d8a9eba338b98577d365d27ef93c089ead7ed5850236

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

自身抗原的鉴定仍然是理解和治疗自身免疫性疾病的一项关键挑战。1型自身免疫性多内分泌综合征（APS1）是一种罕见的单基因自身免疫病，表现为广泛性自身免疫，伴有针对多个器官的T细胞和B细胞应答。重要的是，APS1中的自身抗体发现能够揭示基本的疾病发病机制，而且在APS1中发现的许多抗原可扩展至常见的自身免疫性疾病。在此，我们对APS1队列的血清进行了全蛋白质组可编程噬菌体展示（PhIP-Seq），并发现了多个常见的抗体靶点。这些新型自身抗原表现出组织限制性表达，包括在肠内分泌细胞和牙釉质中的表达。通过详细的临床表型分析，我们发现自身抗体与器官限制性自身免疫之间存在新的关联，包括抗KHDC3L自身抗体与早发性卵巢功能不全之间的关联，以及抗RFX6自身抗体与腹泻型肠……之间的关联。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。