pitp-1突变体与pitp-1(RNAi)处理秀丽隐杆线虫转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309580

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含秀丽隐杆线虫在pitp−1调控下的转录组分析结果。实验旨在鉴定pitp−1抑制介导的寿命延长背后的转录机制。对成年第3天（D3A）的pitp−1突变体和pitp−1(RNAi)处理的线虫进行了转录组分析。对所得差异表达谱进行生物信息学通路分析（IPA）揭示，与IIS（胰岛素/IGF-1信号传导）和TOR信号传导通路相关的基因出现显著且协调的下调。因此，该数据集为PITP−1如何在转录水平影响主要长寿调控网络提供了关键的分子见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。