脓肿分枝杆菌长期应激条件下的转录谱:PBS饥饿与钾缺乏休眠

该数据集来自 NCBI,包含脓肿分枝杆菌在长期应激条件下的 RNA-seq 转录谱,应激条件为 PBS 饥饿和钾缺乏,用于模拟持续感染中营养限制和代谢下调的休眠状态

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基因组分类GPL3117736809
GSE293824: Transcriptional profiling of Mycobacterium abscessus under long-term stress conditions: PBS starvation and dormancy under potassium deficiency

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

脓肿分枝杆菌长期应激条件下的转录谱:PBS饥饿与钾缺乏休眠

Transcriptional profiling of Mycobacterium abscessus under long-term stress conditions: PBS starvation and dormancy under potassium deficiency

该数据集来自 NCBI,包含脓肿分枝杆菌在长期应激条件下的 RNA-seq 转录谱,应激条件为 PBS 饥饿和钾缺乏,用于模拟持续感染中营养限制和代谢下调的休眠状态。数据覆盖 1 个文件,样例为 GSE293824_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL31177 和 36809。可用于研究分枝杆菌在营养匮乏和代谢抑制下的基因表达变化,辅助理解休眠机制及持续感染相关生理状态(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 04 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集呈现了脓肿分枝杆菌暴露于长期应激条件下的转录谱,这些条件模拟了持续感染期间遇到的生理状态。对脓肿分枝杆菌培养物进行了 RNA-seq 分析,这些培养物经历了 PBS 饥饿和钾(K⁺)缺乏,模拟了休眠分枝杆菌群体特有的营养限制和代谢下调。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL31177、36809。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE293824

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 18 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集展示了脓肿分枝杆菌在长期应激条件下的转录谱,这些条件模拟了持续感染期间所遇到的生理状态。对经受PBS饥饿和钾(K⁺)缺乏的脓肿分枝杆菌培养物进行了RNA-seq分析,这两种条件模拟了休眠分枝杆菌群体特有的营养限制和代谢下调。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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