基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-21

资源简介

病理性血管生成中内皮细胞异质性的代谢转录组多样性

E-MTAB-8604 是一个以病理性血管生成中内皮细胞异质性为主题的人类转录组数据集，其英文全称为 Endothelial cell heterogeneity in pathological angiogenesis characterized by metabolic transcriptome diversity。该数据集由 EBI 的 Expression Atlas 收录，属于差异表达实验（Differential），在本站归入内分泌、营养和代谢疾病 / 其他分类。数据集以 Homo sapiens 为研究对象，围绕内皮细胞在病理性血管生成过程中的异质性展开，并通过代谢转录组多样性对这一异质性进行刻画。整体而言，该数据集提供了一个从代谢转录组角度观察内皮细胞群体差异的表达实验资源，适合关注血管生成机制与内皮细胞代谢特征差异的研究者参考使用。

【数据集背景】

病理性血管生成是多种疾病过程中的重要环节，内皮细胞作为血管壁的主要构成细胞，其群体内部往往并不均一。该数据集正是围绕这一生物学问题设计，试图以代谢转录组多样性为切入点，刻画病理性血管生成条件下内皮细胞的异质性。数据集在 Expression Atlas 中被标注为差异表达实验，说明其核心目的在于比较不同条件下或不同细胞群体之间的基因表达差异，而非单纯提供静态的表达谱。研究物种为 Homo sapiens，因此其数据直接对应人类样本或人类细胞体系下的转录组测量结果。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Differential，表明其数据内容以差异表达分析为核心组织方式。数据集关注的是内皮细胞异质性，并以代谢转录组多样性作为刻画这一异质性的主要维度，即通过转录组层面的代谢相关表达差异来反映内皮细胞群体之间的区别。源站描述同时给出了实验名称与物种信息，说明该实验属于 Expression Atlas 中的差异表达实验条目。除上述信息外，关于具体样本数量、分组设计、检测平台、基因数量及差异表达结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，即欧洲生物信息研究所维护的 Expression Atlas 资源。Expression Atlas 是一个汇集表达实验并进行统一注释与展示的平台，该数据集在其中以差异表达实验的形式呈现。数据集的物种信息为 Homo sapiens，实验主题为病理性血管生成中的内皮细胞异质性。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及原始数据提交者等具体来源细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与实验类型，该数据集可用于关注病理性血管生成过程中内皮细胞群体差异的研究场景，例如探讨内皮细胞在代谢转录组层面的异质性表现，或作为差异表达分析结果的参考资源。由于其在分类上归入内分泌、营养和代谢疾病 / 其他，也可为代谢相关疾病背景下血管生成问题的研究提供表达数据层面的线索。此外，该数据集可作为 Expression Atlas 差异表达实验的使用示例，供需要了解该平台数据组织方式的用户参考。关于具体可支持的统计分析方法或验证性研究设计，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 ebi.ac.uk 上的 Expression Atlas 获取，用户可按数据集编号 E-MTAB-8604 检索对应实验条目。由于其为差异表达实验，使用时应以差异表达结果为主要关注对象，并结合实验名称所指示的生物学主题理解分组与比较关系。关于数据下载格式、分析流程、参数设置及可视化方式等具体操作说明，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由 Expression Atlas 收录并标注为差异表达实验，物种信息明确为 Homo sapiens，主题与标签信息一致。其限制在于，当前可获得的描述主要集中于实验主题与实验类型层面，缺少样本规模、平台信息、统计阈值及结果验证等方面的细节，因此在使用时需结合源站条目进一步核实。关于数据质量评估指标与已知技术偏差，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas，使用或引用时应遵循源站的相关规定。关于具体的引用文献、作者列表、许可协议及使用条款，源站未提供。

原始链接

https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8604

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8604

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Endothelial cell heterogeneity in pathological angiogenesis characterized by metabolic transcriptome diversity

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别