GR18细胞系RNA-seq鉴定糖皮质激素受体调控基因
该数据集来自EBI Expression Atlas的差异表达实验,物种为Homo sapiens,在GR18细胞系中开展RNA-seq,用于鉴定受糖皮质激素受体调控的基因

基本信息
资源简介
GR18细胞系RNA-seq鉴定糖皮质激素受体调控基因
E-MTAB-6738 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens。该实验在 GR18 细胞系中开展 RNA-seq,目标是鉴定受糖皮质激素受体调控的基因。数据集归类于内分泌系统疾病 / 其他方向,主题标签为 Differential,体现了以差异表达分析为核心的研究设计。整体而言,该数据集为研究糖皮质激素受体在特定细胞背景下的转录调控作用提供了表达谱层面的实验记录,可供关注内分泌相关调控机制的研究者参考与再利用。
【数据集背景】
糖皮质激素受体是一种配体依赖的转录因子,在内分泌系统调控、应激反应及代谢过程中发挥重要作用。理解该受体如何影响基因表达,需要借助可控细胞模型中的转录组测量。E-MTAB-6738 正是围绕这一目标设计的差异表达实验,选用 GR18 细胞系作为研究体系,通过 RNA-seq 检测受糖皮质激素受体调控的基因。该数据集收录于 EBI Expression Atlas,属于该平台中的 Differential 类实验,说明其设计重点在于比较不同实验条件之间的基因表达差异,而非单纯的基线表达谱描述。
【数据内容】
数据集的核心内容是 GR18 细胞系的 RNA-seq 表达数据,用于差异表达分析,进而识别受糖皮质激素受体调控的基因。主题标签 Differential 表明数据组织与呈现围绕组间比较展开。物种信息明确为 Homo sapiens。关于样本数量、测序深度、具体比较分组、基因数量及差异表达结果列表等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,是 EBI Expression Atlas 中的一项实验记录,实验编号为 E-MTAB-6738。源站描述指出其为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens,实验内容为在 GR18 细胞系中开展 RNA-seq 以鉴定受糖皮质激素受体调控的基因。除上述来源与实验类型信息外,关于样本采集流程、文库构建方法、测序平台与试剂等具体实验细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究糖皮质激素受体介导的转录调控,例如在 GR18 细胞背景下考察受体对下游基因表达的影响;也适合作为内分泌系统相关调控机制研究中的差异表达参考数据。由于主题标签为 Differential,其典型用途包括差异表达结果的查询、候选调控基因的筛选,以及与其他转录组实验的对照分析。关于该数据集在特定疾病模型或临床研究中的直接应用,源站未提供。
【使用方法】
使用者可通过 EBI Expression Atlas 平台访问该实验记录,依据实验编号 E-MTAB-6738 定位数据集,并结合 Differential 实验类型理解其分析框架。使用时应以 GR18 细胞系与 Homo sapiens 物种背景为前提解释结果。关于数据下载格式、分析流程、标准化方法及统计阈值等操作层面的具体说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 EBI Expression Atlas,具备明确的实验编号、物种与细胞系信息,实验目的清晰。但其结果基于单一细胞系 GR18 的 RNA-seq 差异表达实验,结论的外推范围受细胞模型限制。关于数据质量评估指标、重复数、批次效应处理及验证实验等信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk,实验编号为 E-MTAB-6738。关于具体的引用文献、作者信息及许可条款,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-6738
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. RNA-seq in GR18 cell line to identify genes regulated by the Glucocorticoid Receptor
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