小鼠绒毛尿囊膜分支期胚胎葡萄糖代谢重编程数据

该数据集来自 Dryad,对应 2016 年关于小鼠胚胎绒毛尿囊膜分支期(CB)能量代谢重编程的研究。研究使用质量标记葡萄糖的代谢组分析,发现胚胎在 CB 阶段通过抑制关键糖酵解酶 PFK-1 和 aldolase,将葡萄糖碳流重定向至戊糖磷酸途径(PPP),同时乳酸池增大、糖酵解对乳酸合成的贡献增

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其他回归Lin28amouseimaging mass spectrometrychorioallantoic branchingEnergy metabolism
Data from: Rewiring of embryonic glucose metabolism via suppression of pfk-1/aldolase during mouse chorioallantoic branching

基本信息

模态
其他
大小
0.06045534 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

小鼠绒毛尿囊膜分支期胚胎葡萄糖代谢重编程数据

Data from: Rewiring of embryonic glucose metabolism via suppression of pfk-1/aldolase during mouse chorioallantoic branching

该数据集来自 Dryad,对应 2016 年关于小鼠胚胎绒毛尿囊膜分支期(CB)能量代谢重编程的研究。研究使用质量标记葡萄糖的代谢组分析,发现胚胎在 CB 阶段通过抑制关键糖酵解酶 PFK-1 和 aldolase,将葡萄糖碳流重定向至戊糖磷酸途径(PPP),同时乳酸池增大、糖酵解对乳酸合成的贡献增加。成像质谱(IMS)可视化显示背侧或后侧神经管、体节和头部间充质等组织富含乳酸。数据可用于研究胚胎发育中的代谢重编程与能量需求适应(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2016。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):使能量代谢状态适应不断变化的生物能量需求,对于伴随大规模细胞增殖和细胞分化的哺乳动物发育至关重要。然而,在绒毛尿囊膜分支(CB)阶段,当母胎之间的气体和营养物质交换得到促进时,发育中的胚胎如何满足不断变化的生物能量需求仍不清楚。在本研究中,我们使用质量标记葡萄糖的代谢组分析发现,在 CB 期间,发育中的胚胎通过抑制关键糖酵解酶 PFK-1 和 aldolase,将葡萄糖碳流重定向至戊糖磷酸途径(PPP)。与此同时,胚胎的乳酸池大小增加,糖酵解对乳酸生物合成的分数贡献也增加。成像质谱(IMS)可视化了富含乳酸的组织,如背侧或后侧神经管、体节和头部间充质。

【主题与分类】

主题标签:Lin28a、mouse、imaging mass spectrometry、chorioallantoic branching、Energy metabolism。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.fj0qj

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.fj0qj

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 60.5 MB。

数据说明

适应能量代谢状态以应对不断变化的生物能量需求,对于伴随大规模细胞增殖和细胞分化的哺乳动物发育至关重要。然而,在绒毛尿囊膜分支(CB)阶段,当母胎间气体和营养物质交换得到促进时,发育中的胚胎如何满足不断变化的生物能量需求,目前仍不清楚。在本研究中,我们利用质谱标记葡萄糖的代谢组学分析发现,在CB期间,发育中的胚胎通过抑制关键糖酵解酶PFK-1和醛缩酶,将葡萄糖碳流重新导向磷酸戊糖途径(PPP)。与此同时,胚胎中乳酸池大小增加,糖酵解对乳酸生物合成的分数贡献也增加。成像质谱(IMS)可视化了富含乳酸的组织,如背侧或后侧神经管、体节和头部间充质。此外,我们发现异时性基因Lin28a可作为CB期间所观察到的代谢变化的调节因子。通过抑制Lin28a下调来干扰葡萄糖代谢重编程,导致了围产期致死。

因此,我们的研究表明,发育中的胚胎在CB后通过重编程葡萄糖代谢来支持正常发育。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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