脂肪酸代谢重编程视网膜动脉阻塞免疫微环境的多组学数据与代码

该数据集来自一项研究脂肪酸代谢与视网膜动脉阻塞(RAO)免疫失调的多组学研究,包含66例RAO患者(34例伴血脂异常、32例不伴)和66例白内障对照的血清代谢组学、外周血单个核细胞(PBMC)转录组学及免疫表型数据

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基因组分类FOS: Medical and health sciencesFOS: Clinical medicineFOS: Medical biotechnologyRetinal artery occlusionFatty Acid MetabolomicsImmune regulation
Data and code from: Fatty acid metabolism reprograms immune microenvironment in retinal artery occlusion: Multi-Omics analysis highlights immunometabolic crosstalk

基本信息

模态
基因组
大小
0.019138637 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-17
版本
4

资源简介

脂肪酸代谢重编程视网膜动脉阻塞免疫微环境的多组学数据与代码

Data and code from: Fatty acid metabolism reprograms immune microenvironment in retinal artery occlusion: Multi-Omics analysis highlights immunometabolic crosstalk

该数据集来自一项研究脂肪酸代谢与视网膜动脉阻塞(RAO)免疫失调的多组学研究,包含66例RAO患者(34例伴血脂异常、32例不伴)和66例白内障对照的血清代谢组学、外周血单个核细胞(PBMC)转录组学及免疫表型数据。分析采用sPLS-DA、OPLS-DA、随机森林建模和SHAP评估,识别关键代谢与免疫特征,如差异脂肪酸代谢物(C22:5n-3、C22:2n-6、C22:1n-9、C20:2n-6)、相关基因表达变化及免疫细胞改变(中性粒细胞升高、淋巴细胞减少)。数据可用于探索RAO发病中的代谢-免疫串扰,并支持生物标志物发现与治疗靶点研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含一项研究视网膜动脉阻塞(RAO)中脂肪酸代谢与免疫失调的综合多组学数据。数据包括66例RAO患者(34例伴血脂异常,32例不伴)和66例白内障对照的血清代谢组学图谱、外周血单个核细胞(PBMC)转录组学及免疫表型。应用的分析方法包括多变量分析(sPLS-DA、OPLS-DA)、随机森林建模和SHAP评估,以识别关键代谢与免疫特征。该数据集突出显示了差异脂肪酸代谢物(如C22:5n-3、C22:2n-6、C22:1n-9、C20:2n-6)、相关基因表达变化及免疫细胞改变(中性粒细胞升高、淋巴细胞减少)。这些数据支持探索RAO发病机制中的代谢-免疫串扰,并为生物标志物发现和治疗靶点研究提供资源。

【主题与分类】

主题标签:Retinal artery occlusion、Fatty Acid Metabolomics、Immune regulation。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.98sf7m0wt

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.98sf7m0wt

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 19.1 MB。

数据说明

该数据集包含一项研究整合的多组学数据,该研究探讨了视网膜动脉阻塞(RAO)中的脂肪酸代谢与免疫失调。数据包括66例RAO患者(34例伴有血脂异常,32例不伴血脂异常)和66例白内障对照者的血清代谢组学图谱、外周血单个核细胞(PBMC)转录组学及免疫表型分析。所应用的分析方法包括多变量分析(sPLS-DA、OPLS-DA)、随机森林建模和SHAP评估,以识别关键的代谢和免疫特征。该数据集突出了差异脂肪酸代谢物(例如C22:5n-3、C22:2n-6、C22:1n-9、C20:2n-6)、相关的基因表达变化以及免疫细胞改变(中性粒细胞升高、淋巴细胞减少)。这些数据支持探索RAO发病机制中的代谢-免疫串扰,并为生物标志物发现和治疗靶点验证提供资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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