糖尿病肾病内源性活性代谢物的网络药理学与分子对接研究数据集
该数据集是一个整合了代谢组学、蛋白质组学、网络药理学和分子对接技术的医学研究数据集,主要包含从小鼠糖尿病肾病模型中筛选的130种差异表达代谢物、相关差异表达蛋白质、代谢物-靶蛋白相互作用网络数据以及基因本体和信号通路富集分析结果,数据模态涵盖代谢物、蛋白质、基因表达和实验验证数据,主要用于研究糖尿病肾病的发病机制、发现潜在治疗靶点,并特别关注2-HPG/SYNJ1信号轴在足细胞保护中的作用机制验证。

基本信息
资源简介
糖尿病肾病内源性活性代谢物的网络药理学与分子对接研究数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Network pharmacology and molecular docking of endogenous active metabolites in diabetic kidney disease》。配套论文《Network pharmacology and molecular docking of endogenous active metabolites in diabetic kidney disease》发表于 Renal Failure(2023),DOI:10.1080/0886022X.2023.2290927。项目资助方:This study was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 82000687, 82170745, and 82100766) and the Research Fund of Shanghai Tongren Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine (2020TRYJ(JC)03).。源站首次发布:2023-12-28。
【数据内容】
源站原始描述:Network pharmacology and molecular docking were used to predict endogenous active metabolites with protective effects in diabetic kidney disease (DKD). We utilized metabolomics to screen differentially expressed metabolites in kidney tissues of mice with type 2 DKD and predicted potential targets using relevant databases. The interaction network between endogenous active metabolites and target proteins was established by integrating differentially expressed metabolites and proteins associated wi…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个,合计 65.92 KB。GC_heatmap_microalbuminuria_group_and_control_group.pdf:application/pdf,21.38 KB。LC_heatmap_microalbuminuria_group_and_control_group.pdf:application/pdf,44.54 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.24912530.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。主题标签:DKD、endogenous active metabolites、network pharmacology、2-hydroxyphenylpropionylglycine、SYNJ1。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。
【获取与许可】
源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Network_pharmacology_and_molecular_docking_of_endogenous_active_metabolites_in_diabetic_kidney_disease/24912530
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Network pharmacology and molecular docking of endogenous active metabolites in diabetic kidney disease. Taylor & Francis. Xie, Xinmiao; Wang, Yanzhe; Chen, Sijia; Liu, Yuyuan; Li, Fengqin; Zeng, Chuchu; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-06-03,引用时请注意版本时效。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个针对糖尿病肾病(DKD)的医学研究数据集,通过整合代谢组学、蛋白质组学、网络药理学和分子对接技术,系统研究了内源性活性代谢物在DKD中的作用机制。数据内容包括:1)从小鼠2型糖尿病肾病肾组织筛选出的130种差异表达代谢物;2)通过共表达网络分析和蛋白质组学鉴定的与DKD相关的差异表达蛋白质;3)关键代谢物2-羟基苯丙酰甘氨酸(2-HPG)与靶蛋白突触素1(SYNJ1)的相互作用网络;4)基因本体(GO)和信号通路富集分析结果;5)体内实验验证数据,包括免疫荧光、Western blot和聚合酶链反应等实验结果。该数据集主要用于研究糖尿病肾病的发病机制、发现潜在的治疗靶点,以及探索代谢物-蛋白质相互作用网络在足细胞保护中的作用。
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