单细胞转录组解析TPO-RA关键靶点与ITP免疫微环境特征数据

该数据集来自tandf.figshare.com,配套2026年发表于Platelets的论文,包含3个文件(docx、tiff、xlsx),涉及免疫性血小板减少症(ITP)的骨髓单细胞转录组分析

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2026-04-01 更新
浏览 3
时间序列分类Immune microenvironmentimmune thrombocytopenianetwork pharmacologysingle-cell analysisthrombopoietin receptor agonists
Data from: Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia

基本信息

模态
时间序列
大小
0.046175646 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-04-01
版本
v1

资源简介

单细胞转录组解析TPO-RA关键靶点与ITP免疫微环境特征数据

Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia

该数据集来自tandf.figshare.com,配套2026年发表于Platelets的论文,包含3个文件(docx、tiff、xlsx),涉及免疫性血小板减少症(ITP)的骨髓单细胞转录组分析。研究整合网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA),基于ITP患者与健康对照的骨髓scRNA-seq数据,识别造血骨髓细胞的共表达模块,筛选四种TPO-RAs(romiplostim、eltrombopag、avatrombopag、hetrombopag)的候选靶点,并开展分子对接、拟时序轨迹分析与计算机基因敲低。数据可用于ITP发病机制与TPO-RA靶点研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia》发表于 Platelets(2026),DOI:10.1080/09537104.2026.2651849。源站首次发布:2026-04-01。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):血小板生成素受体激动剂(TPO-RAs)是免疫性血小板减少症(ITP)管理的基石,但其分子机制仍未完全阐明。本研究系统解析了四种TPO-RAs(romiplostim、eltrombopag、avatrombopag、hetrombopag)在ITP发病机制中的关键靶点与信号网络。研究将网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)相结合,使用来自ITP患者与健康对照的骨髓scRNA-seq数据。识别了基于Metacell的造血骨髓细胞共表达模块。药物靶点从多个数据库整理,并通过交集差异表达基因(DEGs)、细胞特异性模块和TPO-RA靶点筛选候选基因。分子对接、拟时序轨迹分析和计算机基因敲低被用于

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 46.18 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.31911759.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:Immune microenvironment、immune thrombocytopenia、network pharmacology、single-cell analysis、thrombopoietin receptor agonists。本站分类:免疫系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Single-cell_transcriptome_deciphers_key_targets_of_thrombopoietin_receptor_agonists_and_immune_microenvironment_characteristics_of_immune_thrombocytopenia/31911759

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia. Taylor & Francis. Wang, Wanru; Wang, Haoxu; Wan, Xiaohan; Cao, Junying; Wang, Ruixue; Hou, Ming

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命令行下载

curl -L -o "iplt_a_2651849_sm8088.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/63363335"
curl -L -o "iplt_a_2651849_sm8087.tiff" "https://ndownloader.figshare.com/files/63363337"
curl -L -o "iplt_a_2651849_sm8086.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/63363339"

文件清单

  • iplt_a_2651849_sm8088.docx(21.25 MB)
  • iplt_a_2651849_sm8087.tiff(24.64 MB)
  • iplt_a_2651849_sm8086.xlsx(286.45 KB)

文件总体积 46.18 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

血小板生成素受体激动剂(TPO-RAs)是免疫性血小板减少症(ITP)治疗的基石,但其分子机制仍未完全阐明。本研究系统解析了四种TPO-RAs(罗米司亭、艾曲泊帕、阿伐曲泊帕、海曲泊帕)在ITP发病机制中的关键靶点与信号网络。研究将网络药理学与基于ITP患者及健康对照骨髓scRNA-seq数据的单细胞高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)相结合,识别了基于Metacell的造血骨髓细胞共表达模块。药物靶点从多个数据库中整理获得,并通过交集差异表达基因(DEGs)、细胞特异性模块与TPO-RA靶点筛选候选基因。采用分子对接、拟时序轨迹分析及计算机模拟基因敲低进行功能验证。交集分析揭示了五个关键基因(CACNA1A、CSF1R、PKN1、CD9、DSTYK)。分子对接表明TPO-RAs与关键靶点之间具有强结合亲和力。

ITP骨髓微环境表现出细胞间通讯的重塑,T细胞启动的信号传导增强,巨核细胞-T细胞相互作用异常。拟时序分析揭示了巨核细胞成熟动态的紊乱。计算机模拟敲低显示,CACNA1A、CSF1R和PKN1的失调加剧了中性粒细胞过度活跃,而CD9和DSTYK敲低则损害了有丝分裂调控。本研究阐明了TPO-RAs的作用机制,突出了五个关键基因在ITP中协调失调的血小板生成和免疫功能障碍。计算机模拟策略的整合确定了优化ITP治疗的新靶点。

l 免疫性血小板减少症(ITP)是最常见的获得性出血性疾病。其特征为患者高度异质性、血小板计数异常降低及出血风险升高,严重损害患者的生活质量。
l 血小板生成素受体激动剂(TPO-RAs)广泛用于ITP的治疗。然而,部分患者对TPO-RAs表现出耐药性,其治疗效应背后的精确分子机制尚不清楚。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.31911759.v1(source: https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Single-cell_transcriptome_deciphers_key_targets_of_thrombopoietin_receptor_agonists_and_immune_microenvironment_characteristics_of_immune_thrombocytopenia/31911759)。

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