糖尿病肾病内源性活性代谢物的网络药理学与分子对接研究
该数据集整合了糖尿病肾病小鼠模型的代谢组学和蛋白质组学数据，包含130种差异表达代谢物及相关差异表达蛋白，通过构建代谢物-靶蛋白相互作用网络，结合网络药理学与分子对接分析，揭示了内源性代谢物2-HPG通过调节SYNJ1影响足细胞足突蛋白WT-1表达的分子机制，为糖尿病肾病的病理机制研究和潜在治疗靶点发现提供了关键的多模态生物分子数据支持。
基本信息
资源简介
糖尿病肾病内源性活性代谢物的网络药理学与分子对接研究
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Network pharmacology and molecular docking of endogenous active metabolites in diabetic kidney disease》。配套论文《Network pharmacology and molecular docking of endogenous active metabolites in diabetic kidney disease》发表于 Renal Failure（2023），DOI：10.1080/0886022X.2023.2290927。项目资助方：This study was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 82000687, 82170745, and 82100766) and the Research Fund of Shanghai Tongren Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine (2020TRYJ(JC)03).。源站首次发布：2023-12-28。
【数据内容】
源站原始描述：Network pharmacology and molecular docking were used to predict endogenous active metabolites with protective effects in diabetic kidney disease (DKD). We utilized metabolomics to screen differentially expressed metabolites in kidney tissues of mice with type 2 DKD and predicted potential targets using relevant databases. The interaction network between endogenous active metabolites and target proteins was established by integrating differentially expressed metabolites and proteins associated wi…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 65.92 KB。GC_heatmap_microalbuminuria_group_and_control_group.pdf：application/pdf，21.38 KB。LC_heatmap_microalbuminuria_group_and_control_group.pdf：application/pdf，44.54 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.24912530.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。主题标签：DKD、endogenous active metabolites、network pharmacology、2-hydroxyphenylpropionylglycine、SYNJ1。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Network_pharmacology_and_molecular_docking_of_endogenous_active_metabolites_in_diabetic_kidney_disease/24912530
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Network pharmacology and molecular docking of endogenous active metabolites in diabetic kidney disease. Taylor & Francis. Xie, Xinmiao; Wang, Yanzhe; Chen, Sijia; Liu, Yuyuan; Li, Fengqin; Zeng, Chuchu; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于糖尿病肾病（DKD）的内源性活性代谢物研究，通过整合代谢组学与蛋白质组学数据，结合网络药理学和分子对接方法，预测并验证具有保护作用的代谢物及其作用机制。数据集包含从小鼠2型糖尿病肾病模型肾组织中筛选出的130种差异表达代谢物，以及通过蛋白质组学鉴定的相关差异表达蛋白。研究进一步构建了代谢物与靶蛋白的相互作用网络，并进行了基因本体（GO）和信号通路富集分析。关键发现是代谢物2-羟基苯丙酰甘氨酸（2-HPG）可通过调节突触素1（SYNJ1）的构象和活性，影响足细胞足突标志蛋白WT-1的表达，从而在DKD进展中发挥保护作用。该数据集为糖尿病肾病的机制研究和潜在治疗靶点发现提供了重要的多组学数据支持。
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