尿液生物标志物作为脓毒症相关急性肾损伤诊断工具的验证

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01981993

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：重症监护病房中的脓毒症。背景：脓毒症患者急性肾损伤的早期诊断和预后判断，对于加深我们对该疾病的理解以及评估针对该病症的新干预措施至关重要。目前已提出多种尿液生物标志物，但似乎没有任何单一标志物能够在临床和常规生化参数之外持续提供额外信息。一些作者提出使用一组尿液生物标志物来提高准确性。然而，这种方法迄今尚未在大量脓毒症患者中进行测试。此外，更新且性能更高的分析技术已经开发出来，值得在临床领域进行测试。患者与方法：将纳入至少150例连续入住三级护理重症监护病房（ICU）的脓毒症患者。在膀胱置管后，将于入院后0、4小时和24小时时间点采集尿液样本，并在第1-5天每日继续采集。样本将立即离心并冷冻于-80°C直至分析。

在质谱分析之前，将通过去除较大蛋白质（>20kDa）和脱盐步骤来提取样本。研究人员将使用毛细管电泳-质谱联用技术（CE-MS）评估可预测AKI的尿液肽段：由20种肽段构成的AKI标志物模式，该模式此前已在ICU患者队列中建立。同时，样本将使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）进行分析，这是CE-MS的替代平台，目前正在开发用于ICU常规使用。所涉及技术的概念验证已成功应用于一组尿液样本，这些样本来自诊断为糖尿病的患者，表现为正常白蛋白尿（对照）和大量白蛋白尿（病例）。患者的临床、人口学和生化数据将在最初5天内收集。患者结局 * 短期： * 急性肾损伤的发生

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。