1型糖尿病与非糖尿病青少年尿液肽组学数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD012210

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管糖尿病肾病的早期机制尚不清楚，但普遍认为慢性高血糖会破坏糖尿病肾脏中的蛋白水解环境，并可能促成早期肾损伤。因此，我们在微量白蛋白尿出现之前对1型糖尿病进行了机制性肽组学研究。在由30名参与者组成的发现队列中，我们从753种蛋白质中鉴定出6550个肽段。在去除假阳性结果和潜在污染物后，共有6323个定量肽段：其中5708个肽段可见于1型糖尿病青少年，5011个见于健康对照，4396个为两组共有。应用100%的截断标准后，有162个肽段在每一份尿液样本中均被发现。从该子集中，有15个肽段在1型糖尿病青少年与其非糖尿病同龄人之间的排泄存在差异（P < 0.05，t检验）；经Benjamini-Hochberg校正后，有5个仍具有显著性（Q < 0.05）。使用平行反应监测（单独的PRIDE文件）在第二个由30名参与者组成的队列中验证了6个肽段的排泄率。

有趣的是，这些肽来源于尿调节素C末端附近的一个小区域，尿调节素是一种肾脏特异性蛋白。对切割位点的计算机分析表明，多种参与伤口愈合的金属蛋白酶和丝氨酸蛋白酶可能参与其中。其中两种尿调节素肽在培养的肾小管细胞中以TLR4依赖的方式激活NFκB，并在体外促进中性粒细胞迁移。总之，尿调节素肽的差异性排泄可能有助于揭示糖尿病肾脏早期炎症过程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。