基本信息

模态

基因组

任务类型

预测

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

糖尿病药物反应多组学研究（DIAMOND）

PRJNA996302 是一个以糖尿病药物反应多组学研究为核心的数据集，英文全称为 Diabetes Multi-omic Investigation of Drug Response，简称 DIAMOND。该数据集收录于 NCBI 的 BioProject 数据库，属于内分泌、营养和代谢疾病领域下的糖尿病方向。BioProject 作为生物数据的集合，围绕单一研究计划组织，来源于单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以链接该项目所产生的多种数据类型。DIAMOND 数据集的主题标签为表型或基因型，意味着其内容可能涉及与糖尿病药物反应相关的表型和基因型信息，可用于多组学层面的分析以及药物反应预测等任务。整体而言，该数据集为研究糖尿病药物反应提供了一个多组学数据整合与访问的入口，有助于相关领域的研究人员获取和利用该项目产生的生物数据。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，其英文名称为 PRJNA996302: Diabetes Multi-omic Investigation of Drug Response (DIAMOND)。BioProject 的设计目的是汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可以来自单一组织或联合体。每个 BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，以便找到该项目所产生的各种数据类型。DIAMOND 项目聚焦于糖尿病药物反应的多组学研究，属于内分泌、营养和代谢疾病分类下的糖尿病主题。其主题标签为表型或基因型，表明该项目关注与药物反应相关的表型和基因型信息。该数据集所在的源站为 ncbi.nlm.nih.gov，用户可以通过该站点访问 BioProject 记录并获取相关数据链接。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Phenotype or Genotype”，即表型或基因型。根据源站描述，BioProject 记录本身并不直接存储所有数据，而是提供链接以指向该项目产生的多种数据类型。因此，DIAMOND 数据集的内容可能涵盖与糖尿病药物反应相关的表型和基因型数据，并可能涉及多组学层面的信息。然而，关于具体的数据类型、样本数量、组学层次、变量列表或数据文件格式等详细内容，源站未提供。该数据集可用于研究糖尿病药物反应相关的表型或基因型信息，支持多组学层面的分析与药物反应预测等任务，但具体的数据内容需通过 BioProject 记录中的链接进一步获取。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体位于 NCBI 的 BioProject 数据库，ID 为 996302。BioProject 记录来源于单一组织或联合体，但关于该项目的具体提交机构、研究团队、采集地点、采集时间、样本来源或伦理审批等信息，源站未提供。用户可以通过 NCBI BioProject 页面访问该记录，并获取指向该项目所产生的多种数据类型的链接。该数据集的分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病，主题标签为表型或基因型，这些信息可用于初步了解该项目的领域归属和研究方向。

【适用场景】

该数据集适用于研究糖尿病药物反应相关的表型或基因型信息。由于 BioProject 提供统一入口以链接多种数据类型，该数据集可支持多组学层面的分析，例如整合基因组、转录组、代谢组等不同层次的数据，以探索糖尿病药物反应的机制或预测药物反应。此外，该数据集也可用于药物反应预测等任务，帮助研究人员识别与药物反应相关的生物标志物或构建预测模型。其主题标签“Phenotype or Genotype”表明，该数据集可能适用于表型-基因型关联分析、药物基因组学研究或精准医学领域的探索。然而，具体适用场景需结合项目实际产生的数据类型和用户的研究目标来确定。

【使用方法】

用户可以通过 NCBI 的 BioProject 数据库访问该数据集，具体记录 ID 为 996302。BioProject 记录提供统一入口，用户可以在该页面找到指向该项目所产生的多种数据类型的链接。用户可以根据自身研究需求，选择下载或访问相应的数据文件。由于 BioProject 本身不直接存储所有数据，用户可能需要通过链接跳转至其他数据库或存储库以获取具体数据。关于数据的具体使用方式、分析工具、预处理步骤或代码示例，源站未提供。用户应参考 NCBI 提供的通用文档或相关数据类型的标准使用指南。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。BioProject 记录提供统一入口以链接多种数据类型，但关于该数据集的具体质量指标、数据完整性、准确性、批次效应、缺失值处理或质量控制流程等信息，源站未提供。此外，该数据集的样本量、数据规模、覆盖范围或潜在偏差等信息也未在源站描述中说明。用户在使用该数据集时，应自行评估数据质量，并参考原始数据来源的详细文档。由于 BioProject 仅提供链接，用户需注意不同数据类型的访问权限和可用性可能有所不同。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI 的通用引用指南和许可政策，并遵循相关数据来源的引用要求。由于 BioProject 记录本身可能不包含具体的引用信息，用户应通过项目页面或相关数据链接获取更详细的引用和许可说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA996302

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA996302

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

糖尿病药物反应多组学研究（DIAMOND）队列是一个基于人群的2型糖尿病（T2D）患者队列，这些患者通过服务于密歇根州东南部和底特律大都会区的大型卫生系统接受医疗照护。该队列体现了其来源人群的多样性。由于其健康计划会员身份，参与者拥有与其医疗照护相关的丰富纵向临床健康信息数据集。DIAMOND研究的目的是利用基因组分析、药物暴露信息以及电子健康记录（EHR）衍生的结局数据，识别治疗反应的遗传预测因子。全基因组基因分型使用AxiomTM精准医学研究阵列（ThermoFisher Scientific Inc.）进行。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别