病毒感染引起肠道菌群失调促进1型糖尿病发病
该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA855481),主题为病毒感染引起肠道菌群失调从而促进1型糖尿病发病

基本信息
资源简介
病毒感染引起肠道菌群失调促进1型糖尿病发病
PRJNA855481 是一个来自 NCBI BioProject 的生物学项目数据集,其英文名称为“Virus Infection Causes Intestinal Dysbiosis to Promote Type 1 Diabetes Onset”。从名称可以看出,该数据集围绕病毒感染、肠道菌群失调与1型糖尿病发病之间的关联展开。项目记录本身是 NCBI BioProject 体系中的一条条目,编号为 855481,主题标签为“Raw sequence reads”,表明其涉及原始测序读长数据。本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,便于在糖尿病相关数据资源中检索和定位。整体而言,该数据集为研究病毒感染如何通过影响肠道微生物群落、进而促进1型糖尿病发生这一科学问题,提供了可关联和可获取的生物学数据入口。
【数据集背景】
该数据集对应的 BioProject 记录编号为 PRJNA855481,标题为“Virus Infection Causes Intestinal Dysbiosis to Promote Type 1 Diabetes Onset”。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目组织方式,用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物学数据。根据源站描述,一个 BioProject 通常来源于单一机构或联盟,旨在为用户提供一个统一入口,以便找到该项目所产生的不同类型的数据。该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,说明其数据内容与原始测序读长相关。本站分类将其置于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病类别,反映出该研究与1型糖尿病这一代谢性疾病主题的关联。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其包含原始序列读长数据。源站描述指出,BioProject 记录本身并不直接等同于某一类具体数据文件,而是提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接。因此,该数据集的内容核心是围绕“病毒感染引起肠道菌群失调从而促进1型糖尿病发病”这一研究主题所产生的原始测序读长。关于具体的测序平台、样本数量、读长长度、数据量大小、文件格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录,编号为 855481。源站描述说明,BioProject 记录来源于单一组织或联盟,用于汇集与某一研究计划相关的生物学数据。该数据集的英文名称和标题均指向病毒感染、肠道菌群失调与1型糖尿病发病之间关系的研究。关于样本采集地点、采集时间、受试者或模型生物信息、伦理审批信息等具体采集细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与1型糖尿病发病机制相关的研究场景,尤其是关注病毒感染、肠道菌群失调与自身免疫性糖尿病之间关联的分析。由于主题标签为“Raw sequence reads”,其原始测序读长可用于微生物组分析、序列比对、物种注释、差异丰度分析等下游处理。此外,该数据集也可作为 BioProject 体系中的一个条目,用于检索和关联同一项目下的其他数据类型。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定人群研究等具体应用,源站未提供。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 数据库,以编号 PRJNA855481 或标题“Virus Infection Causes Intestinal Dysbiosis to Promote Type 1 Diabetes Onset”进行检索,获取该项目的记录页面。根据源站描述,BioProject 记录提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接,用户可据此进一步访问相关的原始测序读长数据。关于具体的下载方式、数据格式转换、分析流程、软件工具推荐等操作细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库中的项目记录。源站描述强调 BioProject 是汇集多种数据类型的入口,但未对该数据集的数据质量、完整性、准确性或覆盖范围作出具体说明。关于原始测序读长的质量评分、污染控制、批次效应、样本代表性等质量相关指标,源站未提供。此外,该数据集在糖尿病分类下的具体适用范围和限制,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 记录。关于该数据集的引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策以及是否需要获得额外授权等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA855481
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
自身免疫性疾病,如1型糖尿病(T1D),是由遗传变异和环境扰动等多种因素引起的极其复杂的疾病。肠道微生物组成和肠道病毒感染这两种外源性因素,已分别在人类和动物模型中与T1D发病相关联。本数据集探讨了微生物组与柯萨奇病毒B4(CVB4)之间的相互作用,CVB4是一种肠道病毒,可加速非肥胖糖尿病(NOD)小鼠中T1D的发病。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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