Bil-Gel@miR-sEV治疗感染性糖尿病小鼠创面的转录组测序数据

该数据集来自NCBI,为感染性糖尿病小鼠创面组织的RNA测序原始序列数据,包含感染性糖尿病创面对照组与Bil-Gel@miR-sEVs治疗组样本

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1528919: Transcriptomic profiling of infected diabetic wounds in mice following Bil-Gel@miR-sEV treatment

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

Bil-Gel@miR-sEV治疗感染性糖尿病小鼠创面的转录组测序数据

PRJNA1528919 数据集聚焦于感染性糖尿病小鼠创面在 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗后的转录组变化,属于内分泌、营养和代谢疾病领域中与糖尿病相关的研究数据。该数据集来源于 NCBI,类型为 RNA 测序原始序列读取(Raw sequence reads),样本涵盖感染性糖尿病创面对照组与 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗组小鼠的创面组织。研究者通过对这些创面组织进行 RNA 测序,旨在刻画治疗相关的基因表达改变以及组织修复相关分子通路的变化,为理解该治疗干预在感染性糖尿病创面愈合过程中的转录组层面作用提供原始测序数据基础。

【数据集背景】

糖尿病创面愈合困难,合并感染后病情更为复杂,是糖尿病相关研究关注的重要问题。该数据集对应的研究以感染性糖尿病小鼠创面为对象,围绕 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗展开转录组层面的分析。研究通过 RNA 测序比较感染性糖尿病创面对照组与接受 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗的小鼠创面组织,目的在于表征治疗相关的基因表达变化以及组织修复相关分子通路的改变。这一背景使该数据集与糖尿病创面修复、感染性创面治疗及转录组响应等研究方向直接相关。

【数据内容】

该数据集的内容为 RNA 测序产生的原始序列读取,主题标签为 Raw sequence reads。样本来自感染性糖尿病小鼠的创面组织,包含感染性糖尿病创面对照组样本与 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗组样本。数据所对应的是创面组织转录组的原始测序结果,可用于后续的基因表达分析与组织修复相关分子通路研究。源站描述指出,该数据集用于研究 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗后感染性糖尿病创面的转录组变化,并刻画治疗相关的基因表达改变与组织修复相关分子通路。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名称为 PRJNA1528919: Transcriptomic profiling of infected diabetic wounds in mice following Bil-Gel@miR-sEV treatment。样本采集对象为感染性糖尿病小鼠的创面组织,研究对这些组织进行了 RNA 测序。数据来源站为 NCBI,属于该站收录的转录组测序数据。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及测序平台等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染性糖尿病创面转录组研究相关场景,包括比较感染性糖尿病创面对照组与 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗组之间的基因表达差异,分析治疗相关的转录组变化,以及探索与组织修复相关的分子通路。由于数据为原始序列读取,也可作为 RNA 测序数据处理与分析的输入材料,用于转录组层面的二次分析。该数据集面向糖尿病创面修复与治疗机制研究,适合需要感染性糖尿病小鼠创面组织转录组原始数据的分析场景。

【使用方法】

该数据集以原始序列读取形式提供,使用时可按照 RNA 测序原始数据的常规处理流程进行质量控制、比对与表达定量等分析,并结合样本分组信息比较感染性糖尿病创面对照组与 Bil-Gel@miR-sEVs 治疗组之间的转录组差异。由于数据主题标签为 Raw sequence reads,使用者需自行完成从原始序列到表达谱的分析步骤。关于具体的测序平台、读长、样本数量及分组细节,源站未提供,使用前应参考源站记录获取相应信息。

【质量与限制】

该数据集为 RNA 测序原始序列读取,来源于 NCBI。源站描述未提供关于数据质量评估、测序深度、样本量、重复设置以及数据完整性等方面的具体指标。该数据集基于小鼠感染性糖尿病创面模型,研究结论的外推需结合模型特点加以考虑。关于数据的具体质量信息与使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名称为 PRJNA1528919: Transcriptomic profiling of infected diabetic wounds in mice following Bil-Gel@miR-sEV treatment。关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1528919

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究对感染性糖尿病创面小鼠的创面组织进行了RNA测序,以探究Bil-Gel@miR-sEVs治疗后的转录组变化。该数据集包含感染性糖尿病创面对照组和Bil-Gel@miR-sEVs治疗小鼠的样本,旨在表征治疗相关的基因表达变化及组织修复相关分子通路。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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