晚期糖基化终产物刺激HUVEC经索拉非尼-罗格列酮纳米粒处理的RNA测序
该数据集来自NCBI,包含六份生物样本的原始序列读段,用于研究自组装索拉非尼-罗格列酮纳米粒(SRNPs)在糖尿病相关内皮损伤体外模型中的转录组变化

基本信息
资源简介
晚期糖基化终产物刺激HUVEC经索拉非尼-罗格列酮纳米粒处理的RNA测序
该数据集来自NCBI,包含六份生物样本的原始序列读段,用于研究自组装索拉非尼-罗格列酮纳米粒(SRNPs)在糖尿病相关内皮损伤体外模型中的转录组变化。人脐静脉内皮细胞(HUVECs)在晚期糖基化终产物(AGEs)单独或AGEs加SRNPs条件下培养48小时,每组三个生物学重复,总RNA经一步柱式法提取后行高通量RNA测序。数据可用于分析SRNPs对血管生成、炎症、缺氧反应及细胞外基质组织相关基因表达与生物学过程的影响,服务于糖尿病视网膜病变机制研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目研究自组装索拉非尼-罗格列酮纳米粒(SRNPs)在糖尿病相关内皮损伤体外模型中相关的转录组变化。人脐静脉内皮细胞(HUVECs)在两种条件下培养48小时:单独晚期糖基化终产物(AGEs)以及AGEs加SRNPs。使用一步柱式法提取总RNA,并通过高通量RNA测序进行分析。该数据集包含六个生物样本,每组三个生物学重复。该研究旨在表征在糖尿病视网膜病变背景下,SRNPs相关的基因表达变化以及与血管生成、炎症、缺氧反应和细胞外基质组织相关的生物学过程。
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1513984
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数据说明
本项目研究自组装索拉非尼-罗格列酮纳米颗粒(SRNPs)在糖尿病相关内皮损伤体外模型中相关的转录组学变化。人脐静脉内皮细胞(HUVECs)在两种条件下培养48小时:单独晚期糖基化终末产物(AGEs)以及AGEs加SRNPs。使用一步柱式法提取总RNA,并通过高通量RNA测序进行分析。该数据集包含六个生物学样本,每组三个生物学重复。本研究旨在表征在糖尿病视网膜病变背景下,与血管生成、炎症、缺氧反应和细胞外基质组织相关的基因表达及生物学过程中SRNPs相关的变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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