妊娠期代谢功能障碍中肠道菌群与胆汁酸相关代谢改变

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1502496),涉及 Homo sapiens 与 Mus musculus,主题为妊娠期代谢功能障碍中肠道菌群与胆汁酸相关代谢改变

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1502496: Gut microbiota and bile acid-associated metabolic alterations in gestational metabolic dysfunction

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

妊娠期代谢功能障碍中肠道菌群与胆汁酸相关代谢改变

PRJNA1502496 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目,编号为 1502496。该项目围绕妊娠期代谢功能障碍展开,聚焦肠道菌群与胆汁酸相关代谢改变这一主题,涉及 Homo sapiens 与 Mus musculus 两类物种。从本站分类来看,该数据集归属于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向。其主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),意味着项目产出的核心数据形式为测序得到的原始读段。该数据集为研究者了解妊娠期代谢功能障碍中肠道微生物与胆汁酸代谢之间的关联提供了可追溯的数据入口。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject,源站标题标注为 Homo sapiens 与 Mus musculus(ID 1502496)。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合,这些数据来自单一机构或联合体。每条 BioProject 记录为用户提供一个统一入口,用以查找该项目所产生的多种数据类型。本项目即属于此类记录,其研究主题为妊娠期代谢功能障碍中肠道菌群与胆汁酸相关的代谢改变,涉及人类与小鼠两种物种,本站将其归类于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向。

【数据内容】

该数据集的主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),表明项目所产出的数据以测序原始读段为主要形式。项目涉及 Homo sapiens 与 Mus musculus,说明数据可能涵盖来自人类与小鼠样本的测序结果。关于具体的样本数量、测序平台、读段长度、数据总量、基因或菌群分类信息等细节,源站未提供。数据集本身作为 BioProject 记录,主要功能是汇集并链接该项目产生的多种数据类型,而非仅包含单一类型的数据文件。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI BioProject 数据库,源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 1502496。根据 BioProject 的一般定义,其数据来源于单一机构或联合体发起的单一研究计划。关于本项目的具体采样地点、采样时间、样本处理流程、伦理审批信息以及研究机构名称等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与妊娠期代谢功能障碍相关的研究场景,尤其是关注肠道菌群与胆汁酸代谢改变之间关联的分析。由于涉及 Homo sapiens 与 Mus musculus 两类物种,该数据可用于跨物种比较或转化医学方向的探索。本站分类将其归入内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向,因此也可能适用于糖尿病相关代谢机制的研究。此外,由于主题标签为原始序列读段,该数据可用于微生物组分析、序列比对、物种注释等生物信息学流程。具体适用性需结合源站提供的完整数据说明进行判断。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 记录(ID 1502496)访问该项目,并借助记录中提供的链接查找该项目产生的多种数据类型。BioProject 记录的设计目的即为用户提供一个统一入口,以便定位与同一研究计划相关的不同数据资源。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具及处理流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集作为 BioProject 记录,其质量与完整性取决于源站所汇集的各数据类型。关于数据的具体质量指标、测序深度、覆盖度、样本重复数以及潜在的批次效应等信息,源站未提供。使用者应注意,BioProject 记录本身是数据集合的索引与入口,具体数据的质量需依据各关联数据资源进行独立评估。此外,该数据集涉及人类样本,使用时应关注相关的数据隐私与伦理要求,但源站未提供具体的许可与限制说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。使用者在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 的通用引用规范以及源站可能提供的具体说明。由于源站未提供明确的许可信息,建议使用者直接访问 NCBI BioProject 记录(ID 1502496)以获取最新的引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1502496

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含来自人类粪便样本和小鼠粪便样本的16S rRNA基因扩增子测序数据,旨在探究与妊娠期代谢功能障碍相关的肠道菌群变化。人类样本包括健康对照者和妊娠期糖尿病患者的粪便菌群图谱,其中还包含妊娠期体重增长亚组。小鼠样本包括粪便菌群移植受体和用于研究疾病相关菌群因果作用的实验验证模型。该数据集涵盖多个物种,包括Homo sapiens和Mus musculus。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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