基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1453568：儿童1型糖尿病口腔微生物失调按C反应蛋白水平分层

该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目，英文名称为“PRJNA1453568: Oral Microbiota Dysbiosis in Pediatric Type 1 Diabetes Stratified by C-Reactive Protein Levels”，对应 NCBI BioProject 编号 1453568，物种来源为 Homo sapiens。其研究主题聚焦于儿童 1 型糖尿病患者的口腔微生物失调，并依据 C 反应蛋白水平对研究对象进行分层。从本站分类来看，该数据集归属于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病类别，主题标签为原始序列读长（Raw sequence reads）。整体而言，该数据集围绕儿童 1 型糖尿病与口腔微生物群落之间的关联展开，并以炎症标志物 C 反应蛋白作为分层依据，为探索口腔微生态在该疾病背景下的变化提供了数据基础。

【数据集背景】

1 型糖尿病是常见的内分泌与代谢性疾病，儿童患者的口腔微生物群落可能发生改变。该数据集所对应的生物项目旨在研究儿童 1 型糖尿病中的口腔微生物失调，并按照 C 反应蛋白水平进行分层。C 反应蛋白是一种常用的炎症相关指标，以其作为分层依据，有助于从炎症状态的角度观察口腔微生物组成的差异。该项目的英文名称直接体现了这一研究设计思路，即“Oral Microbiota Dysbiosis in Pediatric Type 1 Diabetes Stratified by C-Reactive Protein Levels”。本站将该数据集归类于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病，说明其与糖尿病这一代谢性疾病领域密切相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其包含的数据类型为原始序列读长。这类数据通常来自高通量测序，可用于后续的微生物群落组成与多样性分析。该生物项目记录本身是相关生物数据的集合，为用户提供访问该项目所产生多种数据类型的统一入口。除上述主题标签外，关于样本数量、测序平台、序列长度、数据量等具体细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 记录通常汇集与某一项研究计划相关的生物数据，这些数据可能来自单一机构或联合体。该项目的物种来源标注为 Homo sapiens，研究对象为人类。关于样本采集的具体地点、时间、机构、伦理审批信息以及受试者招募方式等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于口腔微生物组相关研究，尤其是针对儿童 1 型糖尿病与口腔微生物失调之间关系的分析。由于项目按 C 反应蛋白水平进行分层，该数据也可用于探索炎症状态与口腔微生物群落特征之间的潜在关联。此外，原始序列读长数据可用于微生物多样性分析、物种组成比较以及差异丰度分析等常见下游应用。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库进行访问，用户可在该项目记录中查找其所链接的多种数据类型。由于主题标签为原始序列读长，使用者通常需要按照原始测序数据的常规处理流程进行质量控制、序列比对或分类学注释等分析。关于该项目是否提供配套的分析流程、参考数据库或预处理数据，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。其主题标签为原始序列读长，意味着数据可能以未经过滤或未经过高级处理的原始形式提供，使用前通常需要自行进行质量控制。关于该数据集的具体质量指标、覆盖度、测序深度、样本量以及潜在偏差等信息，源站未提供。此外，该数据集仅涉及 Homo sapiens，研究结论是否可推广至其他人群或物种，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1453568，引用时应参考该生物项目记录及其关联数据。关于该数据集的具体许可条款、使用限制以及推荐引用格式，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1453568

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1453568

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了按全身炎症状态分层的1型糖尿病（T1D）儿童的口腔微生物组组成。根据C反应蛋白（CRP）水平将参与者分为两组：CRP正常组（N-CRP；CRP < 10 mg/L）和CRP升高组（H-CRP；CRP ≥ 10 mg/L）。采用16S rRNA基因测序，我们分析了口腔微生物群落，以识别与全身炎症相关的微生物特征和菌群失调模式。主要目的是阐明儿童1型糖尿病中口腔菌群失调与炎症生物标志物之间的关系。该数据集为了解自身免疫性疾病中的微生物组-免疫轴提供了宝贵资源，并支持发现用于疾病监测和治疗开发的基于微生物群的生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别