儿童1型糖尿病血糖控制与口腔微生物组特征

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1453429),主题为儿童1型糖尿病中与血糖控制相关的口腔微生物组特征,物种为 Homo sapiens,数据以原始测序读段(Raw sequence reads)形式提供

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1453429: Oral Microbiome Signatures Associated with Glycemic Control in Pediatric Type 1 Diabetes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

儿童1型糖尿病血糖控制与口腔微生物组特征

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项生物项目,编号 1453429,英文名称为“Oral Microbiome Signatures Associated with Glycemic Control in Pediatric Type 1 Diabetes”。其研究主题聚焦于儿童 1 型糖尿病中与血糖控制相关的口腔微生物组特征,研究对象物种为 Homo sapiens。数据以原始测序读段(Raw sequence reads)的形式提供,属于内分泌、营养和代谢疾病领域下的糖尿病相关数据。BioProject 作为生物数据的集合记录,旨在将同一项研究计划所产生的多种数据类型汇聚于一处,便于用户查找和访问。该数据集可用于探索儿童 1 型糖尿病患者口腔微生物组与血糖控制之间的潜在关联,为相关微生物组研究和糖尿病管理研究提供原始测序数据基础。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 1453429。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议所组织的生物数据集合,这些计划通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,用以发现同一项目下产生的多种数据类型。本项目的标题明确指出其研究方向为儿童 1 型糖尿病中与血糖控制相关的口腔微生物组特征,所属分类为内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病。研究对象为 Homo sapiens,即人类。该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其核心数据形式为原始测序读段。

【数据内容】

该数据集提供的数据类型为原始测序读段(Raw sequence reads)。这些读段来源于对口腔微生物组样本的测序,旨在研究与儿童 1 型糖尿病血糖控制相关的微生物组特征。数据以原始序列形式呈现,未经过进一步加工或分析。关于具体的样本数量、测序平台、读段长度、数据量大小、微生物组具体分类信息等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI BioProject,源站为 ncbi.nlm.nih.gov。项目编号为 1453429,英文标题为“Oral Microbiome Signatures Associated with Glycemic Control in Pediatric Type 1 Diabetes”。研究对象物种为 Homo sapiens。关于样本采集的具体地点、时间、受试者招募方式、伦理审批信息、样本处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于口腔微生物组与儿童 1 型糖尿病血糖控制相关的研究场景。研究人员可利用原始测序读段进行微生物组组成分析、差异丰度分析、功能预测等,以探索口腔微生物组特征与血糖控制之间的关联。此外,该数据集也可用于方法学比较、数据再分析或作为相关研究的参考数据。关于具体的适用分析流程或推荐工具,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以原始测序读段形式提供,用户可通过 NCBI BioProject 页面访问并下载相关数据。通常,原始测序读段可用于后续的生物信息学分析,如质量控制、序列比对、微生物分类注释和多样性分析等。关于具体的下载方式、文件格式、数据组织结构和分析建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的原始测序读段,其数据质量取决于原始测序过程及样本处理。关于数据的具体质量指标、覆盖度、污染情况、批次效应等信息,源站未提供。此外,该数据集仅包含原始测序读段,不包含经过加工的分析结果或临床元数据。关于样本量、人群特征、血糖控制的具体测量方式等限制信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 1453429。关于具体的引用方式、许可协议、数据使用限制等信息,源站未提供。用户在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 页面的相关说明,并遵循源站的数据使用政策。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1453429

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了按血糖控制状况分层的1型糖尿病(T1D)儿童的口腔微生物组组成。我们采用16S rRNA基因测序,对两个队列的口腔微生物群落进行分析:控制良好的T1D(HbA1c < 6.5%)和控制不佳的T1D(HbA1c ≥ 6.5%)。主要目标是识别与血糖控制和T1D状态相关的微生物特征及菌群失调模式。该数据集为儿童T1D中微生物组-免疫轴的研究提供了见解,并支持发现基于微生物群的生物标志物,用于疾病监测和治疗开发。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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