基本信息

模态

基因组

任务类型

预测

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1202381：人微生物组来源具降糖活性群体感应肽的计算引导发现与表征

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1202381，英文名称为“Computational-guided discovery and characterization of quorum sensing peptides from human microbiome with hypoglycemic activity”。从名称可以看出，这一项目聚焦于人类微生物组来源的群体感应肽，并借助计算手段进行发现与表征，关注其降糖活性。数据集在分类上归属于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，它为研究微生物组与糖代谢调控之间的关系、探索具有潜在降糖功能的微生物源肽类分子提供了生物数据支撑，适合与糖尿病及代谢研究相关的分析工作参考使用。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项单一研究计划或倡议而汇集的一批生物数据，这些数据可以来自单一机构，也可以来自一个联合体。BioProject 记录的作用，是为用户提供一个统一的入口，以便找到该项目所产生的多种类型的数据。编号 1202381 即对应这样一个项目记录，其研究主题是通过计算引导的方式，从人类微生物组中发现并表征具有降糖活性的群体感应肽。该主题同时涉及微生物组、群体感应、肽类分子以及糖代谢调控等多个方向，因此在疾病分类上被归入内分泌、营养和代谢疾病中的糖尿病相关领域。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读段。这意味着项目所汇集的数据以测序产生的原始读段为主。结合项目名称可知，这些序列数据服务于从人类微生物组中计算引导地发现和表征群体感应肽，并进一步关注其降糖活性。源站未提供关于样本数量、测序平台、读段长度、数据总量、具体物种组成或肽序列条目等更细粒度的信息。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，收录于 NCBI BioProject，项目编号 1202381。BioProject 记录本身定位于汇集与单一研究计划相关的生物数据，并集中提供指向该项目各类数据的链接。源站未提供样本采集地点、采集时间、供体信息、伦理审批信息以及具体的实验流程等细节。

【适用场景】

基于其主题与分类，该数据集可应用于人类微生物组相关研究、群体感应肽的发现与表征分析、以及糖尿病等内分泌与代谢疾病方向的探索性研究。由于数据主题为原始序列读段，也可用于与测序读段处理、微生物组序列分析相关的计算流程。源站未提供关于具体适用分析工具、推荐流程或验证实验的说明。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 NCBI BioProject 编号 1202381 在 ncbi.nlm.nih.gov 上定位该项目，并借助 BioProject 记录集中获取该项目所关联的多种数据类型。源站未提供关于数据下载格式、文件组织方式、预处理步骤或分析参数的具体说明。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于围绕单一研究计划汇集的生物数据集合。其主题标签为原始序列读段，说明数据以测序原始读段为主。源站未提供关于数据质量评估指标、覆盖度、错误率、批次效应或使用限制等方面的具体信息。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1202381

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1202381

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探究肽治疗对糖尿病的影响及其对小鼠肠道微生物组的作用。本项目聚焦于肠道微生物群的宏基因组测序，以探索肽是否改变了肠道微生物群的组成。该数据集包含来自不同组别收集的各种小鼠样本的原始测序数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别