肝细胞 Period 1 独立于核心生物钟决定氧化底物选择
数据围绕肝细胞中 Period 1 基因与氧化底物选择的关系展开,涉及核心生物钟相关研究,本站将其归类于内分泌系统疾病下的糖尿病方向

基本信息
资源简介
肝细胞 Period 1 独立于核心生物钟决定氧化底物选择
PRJNA1161134 是一个围绕肝细胞中 Period 1 基因与氧化底物选择关系展开的测序数据集,其英文标题为“Hepatocyte Period 1 dictates oxidative substrate selection independent of the core circadian clock”。该数据集收录了同名论文中的全部测序数据,主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从研究主题看,该数据集涉及核心生物钟相关机制,并聚焦于肝细胞 Period 1 在氧化底物选择中的作用,本站将其归类于内分泌系统疾病下的糖尿病方向。整体而言,该数据集为研究肝脏代谢调控、生物钟与糖尿病相关代谢异常之间的关系提供了原始测序数据基础。
【数据集背景】
该数据集对应一篇题为“Hepatocyte Period 1 dictates oxidative substrate selection independent of the core circadian clock”的论文。从标题可以看出,研究关注肝细胞中的 Period 1 基因,并探讨其在氧化底物选择方面的作用,同时强调这一作用可能不依赖于核心生物钟。生物钟与代谢调控密切相关,而肝脏是机体重要的代谢器官,因此该研究主题与内分泌代谢领域,尤其是糖尿病相关方向具有关联。本站据此将该数据集归入内分泌系统疾病下的糖尿病分类。该数据集收录了上述论文中的全部测序数据,为相关研究结论提供原始数据支撑。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,即原始序列读段。源站描述指出,该数据集包含标题所述论文中的全部测序数据。因此,其数据内容属于测序产生的原始读段数据,而非经过深度加工或汇总的分析结果。关于具体的测序平台、读段长度、样本数量、物种、组织类型、文库构建方式、数据量大小等细节,源站未提供。该数据集围绕肝细胞 Period 1 与氧化底物选择的关系展开,并涉及核心生物钟相关研究,但除原始序列读段这一主题标签外,未给出更细粒度的数据组成说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 相关数据库中的公开数据条目。其英文名称以 PRJNA1161134 作为标识,通常对应 NCBI 生物项目(BioProject)编号。源站描述说明,该数据集包含论文“Hepatocyte Period 1 dictates oxidative substrate selection independent of the core circadian clock”中的所有测序数据。关于样本采集地点、采集时间、实验条件、伦理审批信息、测序机构等具体采集背景,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签和来源描述,该数据集适用于需要获取原始测序读段的场景,例如围绕肝细胞 Period 1、氧化底物选择、核心生物钟以及内分泌系统疾病特别是糖尿病方向的研究。由于数据集包含论文中的全部测序数据,它可用于支撑或复现该论文相关的测序分析。关于是否适用于其他特定分析流程、是否可用于临床诊断、是否适合作为对照数据集等,源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集以原始序列读段形式提供,通常需要结合相应的测序分析流程进行读取、质控、比对和下游分析。具体的数据下载方式、文件格式、参考基因组版本、分析软件建议、参数设置等,源站未提供。使用者应根据自身研究目的和常规测序数据处理规范进行后续操作。
【质量与限制】
该数据集的主题标签为原始序列读段,源站描述仅说明其包含论文中的全部测序数据。关于数据质量评分、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应、样本量、是否存在缺失或低质量读段等质量相关信息,源站未提供。其分类归属为内分泌系统疾病下的糖尿病方向,但该分类是否代表数据本身的疾病模型或临床属性,源站未提供进一步说明。因此,在使用该数据集时,应结合原始论文及源站页面获取更完整的质量与限制信息。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为“PRJNA1161134: Hepatocyte Period 1 dictates oxidative substrate selection independent of the core circadian clock”。关于具体的引用格式、作者列表、发表期刊、发表日期、数据许可协议、使用限制或授权条款等,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应查阅源站页面及相关论文以确认准确的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1161134
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含题为“肝细胞Period 1独立于核心生物钟决定氧化底物选择”的论文中的所有测序数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




