糖尿病大鼠骨折愈合过程中的mRNA表达

该数据集来自NCBI,标题为糖尿病大鼠骨折愈合过程中的mRNA表达,包含1个文件(GSE76364_series_matrix.txt.gz),采用表达谱芯片平台GPL19836,物种为大鼠(10116)

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其他分类Expression profiling by arrayGPL1983610116
GSE76364: mRNA expression during fracture healing in diabetic rats

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-12

资源简介

糖尿病大鼠骨折愈合过程中的mRNA表达

GSE76364 数据集来自 NCBI,标题为“mRNA expression during fracture healing in diabetic rats”,即糖尿病大鼠骨折愈合过程中的 mRNA 表达数据。该数据集归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,聚焦糖尿病与骨折愈合受损之间的分子层面关联。数据集共包含 1 个文件,文件名为 GSE76364_series_matrix.txt.gz,采用表达谱芯片平台 GPL19836,物种为大鼠(10116),作者为 Shunsuke Takahara,发布时间为 Dec 28 201。整体而言,该数据集为研究糖尿病条件下骨折愈合相关 mRNA 表达变化提供了可下载的芯片表达谱资料。

【数据集背景】

糖尿病(DM)与骨折愈合受损之间的关联,包括延迟愈合和不愈合,已在临床和实验环境中得到记录。为探究这种受损愈合背后的分子特征,研究者针对糖尿病大鼠的骨折愈合过程检测了 mRNA 表达。该数据集正是围绕这一主题构建的表达谱数据资源,其源站描述明确指出研究目的是检查糖尿病大鼠中与骨折愈合受损相关的 mRNA 表达。数据集所属分类为内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向,主题标签包含 Expression profiling by array、GPL19836 和 10116,分别对应表达谱芯片、芯片平台和大鼠物种。

【数据内容】

该数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE76364_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩包格式的系列矩阵文件。数据内容为 mRNA 表达谱,采用表达谱芯片平台 GPL19836 产生,物种为大鼠(10116)。数据集主题标签为 Expression profiling by array,表明其数据类型为微阵列表达谱。源站未提供矩阵文件中具体包含的样本数量、分组设计、探针数量或表达值统计等细节。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Shunsuke Takahara,发布时间为 Dec 28 201。源站描述说明该研究在糖尿病大鼠中检查与骨折愈合受损相关的 mRNA 表达,背景是糖尿病与骨折愈合受损(包括延迟愈合和不愈合)的关联已在临床和实验环境中被记录。除上述信息外,源站未提供具体的实验动物模型构建方式、样本采集时间点、芯片实验流程等采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于糖尿病与骨折愈合关系相关的分子表达研究场景,例如比较糖尿病状态下骨折愈合过程中的 mRNA 表达特征、探索与愈合受损相关的表达变化,以及作为表达谱芯片数据用于方法学验证或与其他大鼠骨折愈合表达数据进行比较分析。其分类归属内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病,也可服务于代谢性疾病对骨愈合影响这一交叉方向的研究。源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的使用说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE76364_series_matrix.txt.gz,按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码问题导致后续分析错误。源站未提供该数据集的具体预处理步骤、归一化方法或推荐的分析流程。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模有限。源站未提供样本量、重复数、数据完整性评估或质量控制指标等信息,因此无法据此判断数据质量水平。使用时应注意其物种为大鼠、平台为 GPL19836、数据类型为表达谱芯片,跨物种或跨平台外推需谨慎。源站未提供其他限制说明。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Shunsuke Takahara,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Dec 28 201。源站未提供具体的引用格式、期刊出处或许可条款信息,使用或再分发前应向源站核实相关要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE76364

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

糖尿病(DM)与骨折愈合受损(包括延迟愈合和不愈合)之间的关联已在临床和实验环境中得到证实。我们研究了糖尿病大鼠中与骨折愈合受损特异相关的mRNA表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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