小鼠胰岛Ca2+振荡的遗传变异揭示胰岛功能的新调控因子

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.j0zpc86jc

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 81.58 GB。

数据说明

胰岛素分泌不足以满足代谢需求会导致糖尿病。Ca2+向β细胞内的流动触发胰岛素释放。由于遗传因素对胰岛分泌反应的变异具有强烈影响，我们对八种遗传背景不同的小鼠品系的胰岛Ca2+动态进行了调查。我们发现，在四种条件下，品系间存在高度变异：1) 8 mM葡萄糖；2) 8 mM葡萄糖加氨基酸；3) 8 mM葡萄糖、氨基酸加10nM GIP；以及4) 2 mM葡萄糖。这些刺激探究了β细胞功能、α细胞向β细胞的信号传导以及肠促胰岛素反应。随后，我们将Ca2+波形组成部分与用于Ca2+测量的相同品系中胰岛蛋白质丰度进行了相关性分析。为了聚焦与人类胰岛功能相关的蛋白质，我们确定了与人类GWAS中血糖相关SNPs邻近的相关小鼠蛋白质的人类直系同源物。几种直系同源物先前已被证明能调节胰岛素分泌（例如ABCC8、PCSK1和GCK），支持了我们的小鼠到人类整合作为发现平台的有效性。

通过整合这些数据，我们提名了调节胰岛Ca2+振荡和胰岛素分泌的新调控因子，这些因子可能与人类胰岛功能相关。我们还提供了一种资源，用于识别适合研究这些调控因子的小鼠品系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。