数据集：GLP-1与糖尿病肾病共享关键分子靶点

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.12jm63zbd

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 31.4 MB。

数据说明

胰高血糖素样肽-1（GLP-1）受体激动剂在糖尿病中具有肾脏保护作用，但将GLP-1信号与糖尿病肾病联系起来的分子机制仍不明确。本研究旨在通过整合UniProt中GLP-1的蛋白质靶点与GeneCards中疾病相关基因，识别GLP-1活性与糖尿病肾脏疾病之间的共享分子靶点。使用STRING和Cytoscape对重叠基因集进行分析，并进行MCODE聚类，随后通过clusterProfiler包进行Gene Ontology和KEGG富集分析。采用HADDOCK进行分子对接，以验证GLP-1与核心网络蛋白之间的结构相互作用。我们识别出17个共享基因，包括STAT3、EP300、MAPK1和INSR，这些基因形成了一个连接密集的聚类，富集于与胰岛素反应、缺氧适应、细胞凋亡和葡萄糖代谢相关的通路。对接分析表明，GLP-1与STAT3、PIK3R1和EP300存在直接且良好的结合，提示涉及转录调控和表观遗传调节的非经典细胞内机制。

这些发现揭示了GLP-1信号传导与糖尿病肾病通路之间的新交汇点，提供了机制上的见解，指导了对潜在分子相互作用的实验测定。这一框架最终可能有助于基于GLP-1调节的肾脏疗法的改进。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。