2型糖尿病相关动脉粥样硬化中MMP2依赖的TGF-β2激活失调损害纤维帽形成数据集
该数据集来自瑞典Malmö的Carotid Plaque Imaging Project生物样本库，包含接受颈动脉内膜切除术患者的人颈动脉斑块样本，涵盖有症状（同侧短暂性脑缺血发作、卒中或一过性黑矇且狭窄>70%）和无症状（狭窄>80%）患者
基本信息
资源简介
2型糖尿病相关动脉粥样硬化中MMP2依赖的TGF-β2激活失调损害纤维帽形成数据集
Dysregulation of MMP2-dependent TGF-ß2 activation impairs fibrous cap formation in type 2 diabetes associated atherosclerosis
该数据集来自瑞典Malmö的Carotid Plaque Imaging Project生物样本库，包含接受颈动脉内膜切除术患者的人颈动脉斑块样本，涵盖有症状（同侧短暂性脑缺血发作、卒中或一过性黑矇且狭窄>70%）和无症状（狭窄>80%）患者。数据集对颈动脉斑块进行了bulk RNA测序，并围绕MMP2依赖的TGF-β2激活与2型糖尿病相关动脉粥样硬化中纤维帽形成的关系开展研究。数据可用于探索糖尿病相关斑块不稳定机制、纤维帽形成相关基因表达及血管平滑肌细胞功能研究（来源 figshare，Restricted Access 许可）。
【数据集背景】
项目资助方：Swedish society for Medical Research。源站首次发布：2024-06-24。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：队列描述：本研究中使用的颈动脉斑块来自Carotid Plaque Imaging Project生物样本库（瑞典Malmö；ClinicalTrials.gov ID NCT05821894）。这些斑块采集自瑞典Malmö的Skåne University Hospital血管科接受颈动脉内膜切除术（CEA）的患者。手术指征为：与同侧症状（短暂性脑缺血发作、卒中或一过性黑矇）相关的斑块且狭窄程度大于70%（经双功超声测量），或来自无症状患者的斑块且狭窄程度大于80%。该研究已获得伦理批准，所有患者均提供了口头和书面知情同意。所有涉及人类受试者的工作均遵循1975年《赫尔辛基宣言》的原则。数据集描述：- 对来自颈动脉斑块的样本进行了bulk RNA测序
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.17044/scilifelab.26063056.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cardiology (incl. cardiovascular diseases)。主题标签：Atherosclerosis、Type 2 Diabetes、Fibrous tissue repair、Vascular smooth muscle cells。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cardiology (incl. cardiovascular diseases)。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Dysregulation_of_MMP2-dependent_TGF-_2_activation_impairs_fibrous_cap_formation_in_type_2_diabetes_associated_atherosclerosis/26063056
使用许可：Restricted Access（https://www.scilifelab.se/data/restricted-access/）。
规范引用：Singh, Pratibha; Sun, Jiangming; Cavalera, Michele; Al-Sharify, Dania; Matthes, Frank; Barghouth, Mohammad; et al. (2024). Dysregulation of MMP2-dependent TGF-ß2 activation impairs fibrous cap formation in type 2 diabetes associated atherosclerosis. Lund University. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-01-15，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
Pratibha Singh; Jiangming Sun; Michele Cavalera; Dania Al-Sharify; Frank Matthes; Mohammad Barghouth; Christoffer Tengryd; Pontus Dunér; Ana Persson; Lena Sundius; Mihaela Nitulescu; Eva Bengtsson; Sara Rattik; Daniel Engelbertsen; Marju Orho-Melander; Jan Nilsson; Claudia Monaco; Isabel Goncalves; Andreas Edsfeldt (2025). Dysregulation of MMP2-dependent TGF-ß2 activation impairs fibrous cap formation in type 2 diabetes associated atherosclerosis [Dataset]. http://doi.org/10.17044/scilifelab.26063056.v1
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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