整合分析框架解耦二甲双胍诱导的网络崩溃与2型糖尿病菌株级失调

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.21969993

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 24.1 MB。

数据说明

手稿“肠道微生物组中的菌株级功能倒置驱动2型糖尿病病理生理学及二甲双胍反应”的完整可复现流程与补充数据。本数据集包含来自拉脱维亚（PRJEB39500）和丹麦MetaHIT（PRJEB4336）队列的245个处理后宏基因组。该流程执行：（1）质控与宿主去除，（2）分类学与功能谱分析，（3）泛基因组分析与菌株系统发育，（4）生态网络（SparCC）与肠型（DMM），（5）差异丰度分析（MaAsLin2），以及（6）机器学习跨队列分类

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。