囊性纤维化中结肠黏膜功能障碍增加对colibactin介导的DNA加合物的易感性数据集

该数据集包含囊性纤维化患者和对照组结肠黏膜活检样本的临床元数据和pks+肠杆菌科定量PCR检测结果,数据模态包括临床表格和分子生物学检测数据,主要用于研究囊性纤维化患者肠道黏膜屏障功能障碍如何增加对colibactin毒素介导的DNA加合物的易感性,为理解囊性纤维化相关结直肠癌风险机制提供实验依据。

DataONE
2023-11-08 更新
浏览 21
pks+ E. coliMedicineHealth and Life Sciences
Dysfunctional mucus structure in cystic fibrosis increases vulnerability to colibactin-mediated DNA adducts in the colon mucosa

基本信息

大小
0.000002637 GB
创建/更新时间
2023-11-08

资源简介

囊性纤维化中结肠黏膜功能障碍增加对colibactin介导的DNA加合物的易感性数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Dysfunctional mucus structure in cystic fibrosis increases vulnerability to colibactin-mediated DNA adducts in the colon mucosa》。

【数据内容】

源站原始描述:Raw data containing the basic clinical metadata and qPCR results for pks+ Enterobacteraceae obtained from colonoscopic mucosal biopsies done in patients with cystic fibrosis and non-cystic fibrosis controls

【主题与分类】

主题标签:pks+ E. coli、Medicine, Health and Life Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256:f0b8d99fceb7b6cb76d0d6a4d3b922c395ef0d408dc49996db686a87b8647d5c

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含从囊性纤维化患者和非囊性纤维化对照组的结肠镜黏膜活检样本中获取的基础临床元数据和pks+肠杆菌科定量PCR结果。数据集主要研究囊性纤维化患者结肠黏膜功能障碍如何增加对colibactin毒素介导的DNA加合物的易感性,涉及结肠黏膜屏障功能、微生物组与宿主相互作用以及DNA损伤机制等研究方向,适用于肠道微生物组研究、囊性纤维化并发症分析和结直肠癌风险因素评估等应用场景。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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