囊性纤维化基因组变异数据集

该数据集是一个包含超过74万条记录的囊性纤维化相关基因组变异数据集,数据模态为基因序列变异数据,以VCF格式存储,主要特征包括染色体位置、等位基因信息、变异质量及样本基因型等,适用于囊性纤维化等遗传疾病的基因组学研究、变异识别与生物信息学分析。

camuljakcamuljak
Hugging Face
2025-12-01 更新
浏览 11
size_categories:100K<n<1Mformat:parquetformat:optimized-parquetmodality:textlibrary:datasetslibrary:dasklibrary:polarslibrary:mlcroissantregion:us
cystic-fibrosis.ex1.eff

基本信息

大小
0.07 GB
创建/更新时间
2025-12-01

资源简介

囊性纤维化基因组变异数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《camuljak/cystic-fibrosis.ex1.eff》。源站首次发布:2025-12-01。

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 68.35 MB。

【主题与分类】

主题标签:size_categories:100K<n<1M、format:parquet、format:optimized-parquet、modality:text、library:datasets、library:dask、library:polars、library:mlcroissant、region:us。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/camuljak/cystic-fibrosis.ex1.eff

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使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("camuljak/cystic-fibrosis.ex1.eff")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install &amp;&amp; git clone https://hf-mirror.com/datasets/camuljak/cystic-fibrosis.ex1.eff

数据说明

这是一个囊性纤维化相关的基因组变异数据集,包含VCF格式的遗传变异数据。数据集提供了染色体位置、参考与替代等位基因、变异质量、过滤状态、信息字段及样本基因型等特征,涵盖超过74万条变异记录。数据来源于Hugging Face平台,主要用于囊性纤维化等遗传疾病的基因组学研究、变异分析与生物信息学分析。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

完整数据卡:huggingface.co/datasets/camuljak/cystic-fibrosis.ex1.eff

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