囊性纤维化支气管上皮感染表达谱
内分泌系统疾病领域表格公开数据集,来源:ncbi。

基本信息
资源简介
囊性纤维化支气管上皮感染表达谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Exposure of cystic fibrosis bronchial epithelial cells (CFBE 41 o-) to Pseudomonas aeruginosa (PA01) biofilms》。源站首次发布:Jul 06 201。
【数据内容】
源站原始描述:In the clinical setting, mutations in the CFTR gene enhance the inflammatory response to P. aeruginosa (PA01) infection, but measurements of the inflammatory response to pathogen stimulation by isolated airway epithelia can yield variable results. In this series, we exposed CFBE41o- cells over-expressing ∆F508/∆F508 CFTR and CFBE41o- cells rescued with wt-CFTR to P. aeruginosa biofilms. P. aeruginosa elicited a more robust increase in cytokine and chemokine expression (e.g., IL-8, CXCL2, CXCL3,…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30439
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30439
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE30439/GDS4252包含囊性纤维化支气管上皮细胞暴露于铜绿假单胞菌生物膜后的表达谱。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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