人类基因组DNA定量PCR:先天性肾上腺皮质增生症及RCCX拷贝数变异的基因拷贝数测定

该数据集包含46个人类基因组DNA样本的qPCR和MLPA实验数据,涉及CYP21A1P、CYP21A2、C4A、C4B等基因的拷贝数测定,数据模态为基因序列和定量实验数值,主要用于先天性肾上腺皮质增生症和RCCX拷贝数变异的分子诊断方法验证与基因组学研究。

Zenodo
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2022-06-29 更新
基因拷贝数检测先天性肾上腺皮质增生症分子诊断
创建时间2022-06-29
更新时间2022-06-29
原始链接

https://zenodo.org/record/6780357

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资源简介

该数据集来源于一项研究,旨在同时评估7种定量聚合酶链反应(qPCR)检测方法在测定RCCX拷贝数变异(CNV)遗传元件基因拷贝数(GCN)方面的性能。研究对46个人类基因组DNA样本进行了单实验室方法验证,采用水解探针的双重qPCR检测,针对导致先天性肾上腺皮质增生症的CYP21A1P和CYP21A2基因。此外,还验证了针对RCCX CNV遗传元件的5种qPCR检测,包括C4A基因、C4B基因、RCCX CNV断点、HERV-K(C4) CNV缺失和插入等位基因。数据集包含基因组DNA样本数据、所有qPCR实验的原始定量循环值、多重连接依赖探针扩增(MLPA)实验的峰高和剂量商,以及基于qPCR和MLPA的详细GCN结果。其他分析结果可在同标题的出版物中获取。该数据集主要用于基因组学、分子诊断和遗传病研究,特别是先天性肾上腺皮质增生症和RCCX拷贝数变异的检测与分析方法开发。

提供机构:Zenodo

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影像Quantitative PCR from human genomic DNA: the determination of gene copy numbers for congenital adrenal hyperplasia and RCCX copy number variation