Idh3g基因数据集

本数据集是一个基因功能数据集,核心内容为Idh3g基因的详细分子与功能注释信息,数据模态包括基因序列、蛋白质功能、细胞定位、代谢通路及疾病关联等多维度文本与结构化数据,主要用于研究该基因在能量代谢(特别是三羧酸循环)中的角色、探索其与肾上腺脑白质营养不良等多种疾病的潜在关联机制,并为相关药物相互作用研究提供基础数据支持。

Rat Genome DatabaseRat Genome Database
rgd.mcw.edu
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Idh3gisocitrate dehydrogenaseRat Genome DatabaseRattus norvegicusprotein-codingcitric acid cycletricarboxylic acid cyclemitochondrionortholog
Idh3g Gene Dataset

基本信息

创建/更新时间
2026-09-28

资源简介

Idh3g基因数据集

【一句话概览】

大鼠基因组数据库中的 Idh3g 为蛋白编码基因,预测其具有酶激活剂活性、异柠檬酸脱氢酶(NAD+)活性和镁离子结合活性,参与异柠檬酸代谢过程与三羧酸循环,定位于光感受器内节,属于异柠檬酸脱氢酶复合体(NAD+),在线粒体中活跃。该基因与人类 IDH3G 直系同源,参与柠檬酸循环、延胡索酸尿症和线粒体复合体 II 缺乏通路,并与 17β-雌二醇、2,3,7,8-四氯二苯并二噁英和 2,4,6-三硝基甲苯相互作用(来源 rgd.mcw.edu)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Idh3g (isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 non-catalytic subunit gamma) - Rat Genome Database》。

【数据内容】

源站原始描述:Predicted to enable enzyme activator activity; isocitrate dehydrogenase (NAD+) activity; and magnesium ion binding activity. Predicted to be involved in isocitrate metabolic process and tricarboxylic acid cycle. Predicted to be located in photoreceptor inner segment. Predicted to be part of isocitrate dehydrogenase complex (NAD+). Predicted to be active in mitochondrion. Orthologous to human IDH3G (isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 non-catalytic subunit gamma); PARTICIPATES IN citric acid cycl…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):预计具有酶激活剂活性、异柠檬酸脱氢酶(NAD+)活性和镁离子结合活性。预计参与异柠檬酸代谢过程和三羧酸循环。预计位于光感受器内节段。预计是异柠檬酸脱氢酶复合体(NAD+)的一部分。预计在线粒体中活跃。与人类IDH3G(异柠檬酸脱氢酶(NAD(+))3非催化亚基γ)同源;参与柠檬酸循环途径、富马酸尿症途径、线粒体复合体II缺乏途径;与17β-雌二醇、2,3,7,8-四氯二苯并二噁英、2,4,6-三硝基甲苯相互作用。

【主题与分类】

主题标签:Idh3g、isocitrate dehydrogenase、Rat Genome Database、Rattus norvegicus、protein-coding、citric acid cycle、tricarboxylic acid cycle、mitochondrion、IDH3G、ortholog。

【获取与许可】

源站页面:https://rgd.mcw.edu/rgdweb/report/gene/main.html?id=2863

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源站:https://rgd.mcw.edu/rgdweb/report/gene/main.html?id=2863

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集聚焦于Idh3g基因(编码异柠檬酸脱氢酶3亚基γ蛋白),详细描述了该基因的分子功能、参与的生物过程及相关的疾病关联。数据内容包括:该基因编码的蛋白质具有酶激活活性、异柠檬酸脱氢酶(NAD+)活性及镁离子结合能力;参与异柠檬酸代谢过程和三羧酸循环;涉及柠檬酸循环、延胡索酸尿症、线粒体复合体II缺乏症等代谢通路;与肾上腺脑白质营养不良、自闭症、常染色体血友病A等疾病存在关联;该蛋白定位于异柠檬酸脱氢酶复合体(NAD+)、线粒体和核仁;并记录了其与多种化学物质(如17β-雌二醇、TCDD、TNT)的相互作用信息。数据来源于大鼠基因组数据库(RGD),主要应用于基因功能注释、代谢通路分析、疾病机制研究与药物相互作用探索等领域。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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