PRJNA1300620：ADAMTSL1 促进肢端肥大症生长激素分泌
摘要：我们发现，在肢端肥大症患者中，adamtsl1 基因表达上调，且生长激素分泌与 adamtsl1 的表达高度相关。我们在 GH3 细胞系中过表达 adamtsl1，该细胞系是大鼠垂体腺瘤细胞系并可分泌生长激素
基本信息
资源简介
PRJNA1300620：ADAMTSL1 促进肢端肥大症生长激素分泌
PRJNA1300620 数据集围绕肢端肥大症中 ADAMTSL1 基因与生长激素分泌之间的关系展开。相关研究发现，在肢端肥大症患者中 adamtsl1 基因表达上调，生长激素分泌与 adamtsl1 的表达高度相关。为深入探究这一关系，研究者在 GH3 细胞系中过表达 adamtsl1；GH3 是大鼠垂体腺瘤细胞系，能够分泌生长激素。研究者分别采集野生型 GH3 细胞系与 adamtsl1 过表达细胞的 RNA，开展 RNA 测序（RNA-seq）分析。该数据集属于内分泌系统疾病中肢端肥大症方向，来源站为 ebi.ac.uk，可为研究 adamtsl1 在垂体腺瘤细胞生长激素分泌调控中的作用提供转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
肢端肥大症是一种与生长激素分泌异常相关的内分泌系统疾病。该数据集所对应的研究关注 adamtsl1 基因在肢端肥大症中的作用。研究发现，肢端肥大症患者中 adamtsl1 基因表达上调，并且生长激素分泌与 adamtsl1 的表达高度相关。基于这一临床观察，研究者进一步在细胞模型中过表达 adamtsl1，以考察其对生长激素分泌相关转录程序的影响。GH3 细胞系为大鼠垂体腺瘤细胞系，可分泌生长激素，因而被选作本研究的体外实验模型。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 RNA 测序（RNA-seq）分析所产生的转录组数据。研究者采集了两类细胞的 RNA：野生型 GH3 细胞系，以及过表达 adamtsl1 的 GH3 细胞。通过对这两组样本进行 RNA-seq，可获得比较 adamtsl1 过表达与野生型状态下基因表达差异的数据基础。数据集英文名称为“PRJNA1300620: ADAMTSL1 stimulate the secretion of growth hormone in acromegaly”，所属分类为内分泌系统疾病 / 肢端肥大症。除上述样本分组与测序类型外，源站未提供关于数据文件数量、数据量大小、测序平台、读长等更细化的描述。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。根据源站描述，研究者在 GH3 细胞系中过表达 adamtsl1，并收集野生型 GH3 细胞系与 adamtsl1 过表达细胞的 RNA 用于 RNA 测序分析。样本材料为大鼠垂体腺瘤细胞系 GH3，实验设计包含野生型与 adamtsl1 过表达两种条件。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及测序服务的具体提供方，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与肢端肥大症及生长激素分泌调控相关的研究场景，例如分析 adamtsl1 过表达对 GH3 细胞转录组的影响、探索 adamtsl1 表达与生长激素分泌相关基因表达变化之间的关系，以及作为垂体腺瘤细胞系转录组研究的参考数据。由于数据来自大鼠垂体腺瘤细胞系的体外实验，其适用场景应限定在细胞模型层面的转录组分析，不宜直接外推为患者群体的临床结论。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 RNA-seq 数据形式提供，使用者可围绕野生型 GH3 细胞与 adamtsl1 过表达 GH3 细胞之间的基因表达差异开展分析。由于源站描述仅说明采集了两类细胞的 RNA 并进行 RNA 测序分析，未提供具体的分析流程、标准化方法、差异表达分析参数或数据下载与处理步骤，相关使用方法源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的实验设计基于 GH3 大鼠垂体腺瘤细胞系的体外过表达模型，样本条件为野生型与 adamtsl1 过表达两组。其局限在于研究结论建立在细胞系层面，与肢端肥大症患者的体内复杂生理环境存在差异；同时，源站描述未提供重复样本数量、测序深度、数据质控指标等信息，因此无法据此评估数据的具体质量水平。关于数据的其他质量与限制信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk，英文名称为“PRJNA1300620: ADAMTSL1 stimulate the secretion of growth hormone in acromegaly”。关于该数据集的引用方式、许可协议及使用条款，源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1300620
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
总结：我们发现，在肢端肥大症患者中，adamtsl1基因表达上调，且生长激素分泌与adamtsl1的表达高度相关。我们在GH3细胞系中过表达adamtsl1，GH3是一种大鼠垂体腺瘤细胞系，可分泌生长激素。我们收集了野生型GH3细胞系和adamtsl1过表达细胞的RNA，用于RNA测序（RNA-seq）分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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