斑马鱼肢端肥大症模型：DNA损伤增加与DNA修复通路受损
该数据集包含基于斑马鱼的肢端肥大症模型RNA-Seq测序数据，数据模态为基因表达谱文本数据，通过过表达生长激素构建疾病模型，揭示了多种器官中DNA损伤标志物的富集以及DNA修复通路的显著受损，主要应用于研究肢端肥大症的分子机制、DNA损伤修复在疾病发展中的作用以及相关并发症的生物学基础。
创建时间2022-02-20
更新时间2022-02-20
原始链接
http://data.iscr.ac.cn/Article?id=930f3278515b96a95ccfbdcad2f211d0
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资源简介
该数据集是一个基于斑马鱼的肢端肥大症模型研究数据集，聚焦于生长激素（GH）过量对细胞完整性的影响。数据集包含通过稳定过表达罗非鱼生长激素和红色荧光蛋白（RFP）报告基因构建的斑马鱼模型，以及从不同器官采集的RNA-Seq测序数据。通过热图、Expression2Kinases（X2K）分析和H2A.X免疫染色，揭示了多种器官中DNA损伤标志物的富集以及DNA损伤细胞数量的显著增加。利用基因集富集分析（GSEA），进一步发现该模型在肝脏中表现出DNA修复通路受损，包括双链断裂修复、同源重组修复、非同源末端连接、核苷酸切除修复和跨损伤合成等。该数据集为研究肢端肥大症并发症的分子机制、DNA损伤与修复在疾病中的作用提供了重要资源，适用于发育生物学、疾病模型构建和基因组稳定性研究。
提供机构：The University of Tokyo
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