潜水继发减压病对人体外周血转录组的急性影响

该数据集来自 EBI 的 Expression Atlas(差异表达实验),物种为 Homo sapiens,聚焦潜水继发减压病对人体外周血转录组的急性影响

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基因组分类Differential
E-MTAB-10388: Acute effects on the human peripheral blood transcriptome of decompression sickness secondary to scuba diving

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

潜水继发减压病对人体外周血转录组的急性影响

E-MTAB-10388 是一个来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens,全称为“Acute effects on the human peripheral blood transcriptome of decompression sickness secondary to scuba diving”。该数据集聚焦于潜水继发减压病对人体外周血转录组所产生的急性影响,属于环境因素所致疾病相关主题。作为 Expression Atlas 中的差异表达实验,它记录了在特定环境暴露条件下人体外周血基因表达变化的信息,可用于了解减压病急性期转录层面的响应特征。以下从背景、内容、来源、应用、使用、质量与引用等方面进行介绍。

【数据集背景】

减压病是潜水活动中因环境压力快速变化而可能发生的一类疾病,属于环境因素所致疾病范畴。该数据集以潜水继发减压病为研究背景,关注其对人体外周血转录组的急性影响。源站将其归类为 Expression Atlas 实验,实验类型为 Differential,即差异表达分析。物种为 Homo sapiens。该数据集的主题标签为 Differential,表明其核心在于比较不同条件下基因表达的差异,而非单纯的表达谱记录。整体而言,该数据集服务于环境暴露与人体急性转录响应之间关系的研究方向。

【数据内容】

该数据集为 Expression Atlas 中的差异表达实验,物种为 Homo sapiens。其内容围绕潜水继发减压病对人体外周血转录组的急性影响展开。源站描述指出,该实验关注的是“Acute effects on the human peripheral blood transcriptome of decompression sickness secondary to scuba diving”。主题标签为 Differential,说明数据涉及差异表达结果。关于具体的样本数量、分组方式、检测平台、基因数量、差异表达基因列表、统计阈值、时间点设置等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即 EBI 的 Expression Atlas。源站描述明确其为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens。数据集英文名称为“E-MTAB-10388: Acute effects on the human peripheral blood transcriptome of decompression sickness secondary to scuba diving”。本站分类为环境因素所致疾病 / 其他。关于样本采集地点、受试者招募方式、潜水条件、采样时间、伦理审批信息、实验操作流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与潜水继发减压病急性效应相关的转录组差异表达研究场景,可用于了解人体外周血在减压病急性影响下的基因表达变化方向。由于其为 Expression Atlas 的差异表达实验,适合用于比较不同条件之间的表达差异,也可作为环境因素所致疾病主题下的参考数据。关于具体的适用分析类型、可支持的统计方法、是否适合 meta 分析、是否可用于临床诊断或预测等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,属于差异表达实验。通常可通过 Expression Atlas 平台访问相关实验页面并获取其提供的差异表达结果。关于具体的下载格式、文件结构、数据处理流程、标准化方法、分析工具推荐、代码示例等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 Expression Atlas 中的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,主题标签为 Differential。关于样本量、重复数、批次效应、数据完整性、质控指标、统计显著性阈值、假发现率控制、平台偏倚、结果可重复性等质量相关信息,源站未提供。使用时应结合源站页面进一步确认数据适用范围与限制。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas,英文名称为“E-MTAB-10388: Acute effects on the human peripheral blood transcriptome of decompression sickness secondary to scuba diving”。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献、许可协议、使用条款、数据共享政策等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-10388

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Acute effects on the human peripheral blood transcriptome of decompression sickness secondary to scuba diving

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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