原发性硬化性胆管炎样本的多组学数据

该数据集来自 figshare,包含原发性硬化性胆管炎患者的 miRNA、蛋白质组学和代谢组学数据,共 4 个文件,涵盖代谢组数据、蛋白质组数据、miRNA 计数及代谢组元数据

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2026-05-06 更新
浏览 9
蛋白质分类primary sclerosing cholangitis (PSC)gene expressionmiRNAmetabolitesmetabolomicsproteomicsinflammatory bowel diseasecholangiocarcinomaproteins
Multiomics data of Primary Sclerosing Cholangitis samples

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000831045 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-05-06
版本
v1

资源简介

原发性硬化性胆管炎样本的多组学数据

Multiomics data of Primary Sclerosing Cholangitis samples

该数据集来自 figshare,包含原发性硬化性胆管炎患者的 miRNA、蛋白质组学和代谢组学数据,共 4 个文件,涵盖代谢组数据、蛋白质组数据、miRNA 计数及代谢组元数据。数据可用于整合多组学信息,研究不同疾病表型之间的差异,包括是否合并炎症性肠病以及是否合并胆管癌(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:Vetenskapsrådet, Sweden。源站首次发布:2026-05-06。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们收集了原发性硬化性胆管炎患者的 miRNA、蛋白质组学和代谢组学数据,以整合多组学数据并研究疾病表型之间的差异,包括是否存在炎症性肠病和胆管癌。

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 831.04 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.30896051.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Gastroenterology and hepatology。主题标签:primary sclerosing cholangitis (PSC)、gene expression、miRNA、metabolites、metabolomics、proteomics、inflammatory bowel disease、cholangiocarcinoma、proteins。本站分类:消化系统疾病/原发性硬化性胆管炎。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Gastroenterology and hepatology。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Multiomics_data_of_Primary_Sclerosing_Cholangitis_samples/30896051

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:NOUAIRIA, Ghada; Bergquist, Annika (2026). Multiomics data of Primary Sclerosing Cholangitis samples. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "metabolomics_data.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/60423344"
curl -L -o "proteomics_data.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/60423347"
curl -L -o "miRNA_counts.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/60423350"
curl -L -o "metabolomics_metadata.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/60423353"

文件清单

  • metabolomics_data.csv(358.48 KB)
  • proteomics_data.csv(229.08 KB)
  • miRNA_counts.csv(179.00 KB)
  • metabolomics_metadata.csv(64.48 KB)

文件总体积 831.04 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

我们收集了原发性硬化性胆管炎患者的miRNA、蛋白质组学和代谢组学数据,以整合多组学数据并研究疾病表型之间的差异,包括是否伴有炎症性肠病和胆管癌。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.30896051.v1(source: https://figshare.com/articles/dataset/Multiomics_data_of_Primary_Sclerosing_Cholangitis_samples/30896051)。

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