MGYS00006807:PRJNA1023929数据集的宏基因组组装(肠易激综合征粪便微生物群与代谢物)

MGYS00006807 是一个以肠易激综合征粪便微生物群和代谢物为背景的宏基因组组装数据集,来源于 ebi.ac.uk,其英文名称同时指向宏基因组组装、PRJNA1023929 数据以及“Fecal microbiota and metabolites in Irritable Bowel Syn

mgnify
浏览 13
基因组分类宏基因组粪便菌群代谢物谱肠易激综合征消化疾病序列组装功能注释数据再分析
MGYS00006807: Metagenome assembly of PRJNA1023929 data set (Fecal microbiota and metabolites in Irritable Bowel Syndrome)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

MGYS00006807:PRJNA1023929数据集的宏基因组组装(肠易激综合征粪便微生物群与代谢物)

MGYS00006807 是一个以肠易激综合征粪便微生物群和代谢物为背景的宏基因组组装数据集,来源于 ebi.ac.uk,其英文名称同时指向宏基因组组装、PRJNA1023929 数据以及“Fecal microbiota and metabolites in Irritable Bowel Syndrome”这一研究主题。该数据集在本站分类中归属于消化系统疾病与肠易激综合征方向。

【数据集背景】

该数据集的英文名为“MGYS00006807: Metagenome assembly of PRJNA1023929 data set (Fecal microbiota and metabolites in Irritable Bowel Syndrome)”。从名称看,它围绕肠易激综合征中的粪便微生物群和代谢物展开,并涉及 PRJNA1023929 这一主数据集。来源站描述指出,该组装是第三方注释组装,衍生自主要数据集 PRJNA1023929。也就是说,它并非一个完全独立于主数据集产生的新测序项目,而是与 PRJNA1023929 存在衍生关系。关于该项目的发起背景、研究目的、疾病定义、样本纳入与排除标准、研究假设以及项目组织方式等,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容是宏基因组组装。名称中明确出现“Metagenome assembly”,说明其数据形态与宏基因组组装结果有关;括号中的描述则表明研究主题涉及粪便微生物群、代谢物以及肠易激综合征。来源站描述进一步说明,这是第三方注释组装,并衍生自 PRJNA1023929 主数据集。关于组装序列数量、总长度、contig 或 scaffold 数量、N50、基因预测结果、功能注释信息、代谢物检测种类、丰度矩阵、分类学组成等具体内容,源站未提供。该数据集是否包含原始测序 reads、注释表格、统计报告或分析脚本,源站也未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。其来源描述指出,第三方注释组装衍生自主要数据集 PRJNA1023929。除这一衍生关系外,关于样本采集地点、采集时间、受试者人群特征、年龄与性别分布、样本类型的具体采集方式、测序平台、文库构建策略、伦理审批信息以及数据产生机构等,源站未提供。因此,无法仅依据现有信息还原完整的实验设计或采样流程。

【适用场景】

源站未提供专门针对该数据集的适用场景说明。就宏基因组组装的一般用途而言,此类数据通常可用于微生物组组成探索、组装结果再利用、功能注释分析或与其他宏基因组数据进行比较等通用方向;但针对 MGYS00006807 的具体适用性、推荐分析目标、是否适合临床解释或代谢物关联分析,源站未提供。若研究问题涉及肠易激综合征、粪便微生物群和代谢物,使用者仍需结合主数据集 PRJNA1023929 及其官方说明进行判断。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用步骤、下载方式、文件格式、访问权限、分析工具或推荐流程。使用者可尝试通过来源站 ebi.ac.uk 查询标识 MGYS00006807,并结合其关联的主数据集 PRJNA1023929 了解获取途径;但具体操作入口、数据组织方式、版本管理方式及配套文档,源站未提供。由于该数据为第三方注释组装,使用前应确认其与主数据集之间的衍生关系,避免将组装结果误认为原始测序数据。

【质量与限制】

源站未提供质量评估信息,包括组装完整度、连续性、污染情况、注释可信度、代谢物数据质量、样本量充分性以及统计功效等。作为第三方注释组装,其质量可能与主数据集 PRJNA1023929 及具体注释过程有关,但相关流程和质控标准源站未提供。该数据集是否适合临床诊断、治疗决策或大规模比较研究,源站未提供依据。使用者应注意到,缺乏质量与限制说明会限制对结果的直接解释,正式分析前需查阅来源站的官方记录。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、许可协议、使用条款、商业使用限制、作者列表、机构信息、DOI 或 PMID 等。若需引用或使用该数据集,应以来源站 ebi.ac.uk 上有关 MGYS00006807 以及主数据集 PRJNA1023929 的官方说明为准。关于是否允许再分发、二次注释、合并分析或商业应用,源站未提供具体信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/metagenomics/studies/MGYS00006807

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

第三方注释(TPA)组装体源自原始数据集 PRJNA1023929

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案