肠道Slc30a1缺陷对小鼠肠上皮细胞基因表达的影响

该数据集来自NCBI GEO,研究肠道Slc30a1缺陷对小鼠肠上皮细胞基因表达的影响。该数据可用于探索Slc30a1在肠道锌稳态及全身稳态中的作用,为锌转运蛋白相关消化系统与遗传代谢性疾病研究提供表达谱资源(来源 NCBI)

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基因组预测GPL2424710090
GSE245786: Effect of intestinal Slc30a1 deficiency on gene expression of intestinal epithelial cells in mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

肠道Slc30a1缺陷对小鼠肠上皮细胞基因表达的影响

Effect of intestinal Slc30a1 deficiency on gene expression of intestinal epithelial cells in mice

该数据集来自NCBI GEO,研究肠道Slc30a1缺陷对小鼠肠上皮细胞基因表达的影响。数据通过高通量测序对表达谱进行分析,包含1个文件(GSE245786_series_matrix.txt.gz),物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。该数据可用于探索Slc30a1在肠道锌稳态及全身稳态中的作用,为锌转运蛋白相关消化系统与遗传代谢性疾病研究提供表达谱资源(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 19 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):锌通过介导许多蛋白质和酶的功能对生物体至关重要。SLC30A和SLC39A家族是哺乳动物中主要的锌转运蛋白,协同调节全身锌稳态。SLC30A和SLC39A家族中多个成员的重要生理和病理作用已在多种组织中被鉴定,尤其是与人类疾病的关系得到验证。了解锌转运蛋白的组织特异性作用将有助于促进调控锌稳态或转运蛋白的治疗策略。已发现SLC30A1在胚胎存活中发挥重要作用,然而其组织特异性作用仍不清楚。在本研究中,我们发现Slc30a1在成年小鼠存活中不可或缺的作用,进一步揭示了肠道Slc30a1对全身稳态的关键影响,与锌相关。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:消化系统疾病/遗传代谢性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE245786

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 01 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE245786

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

锌对生物体至关重要,它通过介导大量蛋白质和酶的功能发挥作用。SLC30A和SLC39A家族是哺乳动物体内主要的锌转运蛋白,协同调控全身锌稳态。SLC30A和SLC39A家族中各成员在多种组织中的重要生理和病理作用已被鉴定,尤其是与人类疾病之间已证实的关联。理解锌转运蛋白的组织特异性作用有助于推动调控锌稳态或转运蛋白的治疗策略。已发现SLC30A1在胚胎存活中发挥重要作用,然而其组织特异性作用仍不清楚。在本研究中,我们发现Slc30a1在成年小鼠存活中具有不可或缺的作用,进一步揭示了肠道Slc30a1对全身稳态的关键影响及其与锌水平的相关性。此外,我们建立了人SLC30A1的冷冻电镜结构,阐明了该转运蛋白的锌转运模式及锌离子选择性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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