S1 File. 原始数据——胃食管反流病与重度抑郁症的孟德尔随机化研究

本数据集为一项孟德尔随机化研究的原始数据文件,聚焦胃食管反流病(GERD)与重度抑郁症(MD)之间的因果关系。研究基于欧洲人群的GWAS数据筛选相关SNP,并从UK Biobank提取GERD与MD的汇总水平数据,以IVW方法为主分析,辅以MR-Egger、最大似然法、MR-PRESSO、MR-RA

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2023-09-28 更新
浏览 4
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S1 File. Raw data -

基本信息

模态
基因组
大小
0.000053473 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-09-28
版本
v1

资源简介

S1 File. 原始数据——胃食管反流病与重度抑郁症的孟德尔随机化研究

S1 File. Raw data -

本数据集为一项孟德尔随机化研究的原始数据文件,聚焦胃食管反流病(GERD)与重度抑郁症(MD)之间的因果关系。研究基于欧洲人群的GWAS数据筛选相关SNP,并从UK Biobank提取GERD与MD的汇总水平数据,以IVW方法为主分析,辅以MR-Egger、最大似然法、MR-PRESSO、MR-RAPS及多种敏感性检验。数据可用于复现或验证GERD与MD因果关联的孟德尔随机化分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-09-28。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究系统探究了胃食管反流病(GERD)与重度抑郁症(MD)之间的因果关系。通过纳入欧洲血统个体的全基因组关联研究(GWAS)筛选与目标疾病相关的单核苷酸多态性(SNPs)。GERD和MD的汇总水平数据提取自UK Biobank。采用逆方差加权(IVW)方法作为主要分析。使用MR-Egger方法、最大似然法、MR-多效性残差和离群值(MR-PRESSO)方法以及MR-稳健调整轮廓评分(MR-RAPS)方法进行敏感性分析。还进行了MR-Egger回归、异质性检验、多效性检验和留一法检验以分析敏感性。使用MR Steiger检验验证暴露对结局的方向性。An ava

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 53.47 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0291086.s006。

【主题与分类】

源站学科分类:Genetics、Biotechnology、Sociology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer、Science Policy。主题标签:study systematically investigated、study reminds clinicians、study provides 100、mendelian randomization study、gastroesophageal reflux disease、wide association study、868 – 2、694 – 2、530 – 2、mr study showed。本站分类:消化系统疾病/胃食管反流病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genetics、Biotechnology、Sociology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer、Science Policy。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/S1_File_Raw_data_-/24213393

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Zheng, Xiaofei; Zhou, Xin; Tong, Li; Gu, Wang; Wang, Siyu; Yuang, Wenkang; et al. (2023). S1 File. Raw data -. PLOS ONE. Dataset

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文件清单

  • pone.0291086.s006.xlsx(53.47 KB)

文件总体积 53.47 KB(源站 API 实测)。

数据说明

本研究系统探究了胃食管反流病(GERD)与重度抑郁症(MD)之间的因果关系。通过纳入欧洲血统个体的全基因组关联研究(GWAS),筛选出与所关注疾病相关的单核苷酸多态性(SNPs)。GERD和MD的汇总水平数据提取自英国生物银行(UK Biobank)。以逆方差加权(IVW)法作为主要分析方法。采用MR-Egger法、最大似然法、MR-多效性残差和离群值(MR-PRESSO)法及MR-稳健调整轮廓评分(MR-RAPS)法进行敏感性分析。同时进行MR-Egger回归、异质性检验、多效性检验和留一法检验以分析敏感性。采用MR Steiger检验验证暴露对结局的方向性。使用可用的网站工具(https://shiny.cnsgenomics.com/mRnd/)计算MR分析的统计效能。应用荟萃分析检验MD对GERD的平均遗传预测效应。我们的MR研究显示,MD与GERD之间存在双向因果关联。

关于MD与GERD的关系,二者之间存在正相关;在IVW方法中,OR分别为1.500(95% CI = 1.320–1.704;P = 4.91E-10)和2.058(95% CI = 1.868–2.267;P = 2.20E-48)。此外,荟萃分析还显示MD与GERD之间存在强烈的正向因果关联。当暴露与结局互换后,GERD的遗传易感性与晚期MD的总体风险显著相关(ieu-a-1187,OR = 1.982,95% CI = 1.694–2.319,P = 1.41E-17;ieu-b-102,OR = 1.612,95% CI = 1.530–2.700,P = 1.15E-70)。我们的研究具有100%的效能来检测MD对GERD的因果效应,反之亦然。遗传预测的MD与更高的GERD风险呈正相关,反之亦然。我们的研究提醒临床医生在诊断和治疗MD时注意筛查GERD,反之亦然。此外,MD与GERD之间可能存在正反馈,治疗和预防一种疾病可能有益于另一种疾病的治疗和预防。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0291086.s006(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/S1_File_Raw_data_-/24213393)。

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