慢性阻塞性肺疾病遗传变异数据集(来自TOPMed的COPDGene和SPIROMICS联合AA人群)

提供来自TOPMed COPDGene与SPIROMICS研究中AA人群与COPD显著关联的遗传变异数据,格式为XLSX,用于遗传关联分析。

Wassim LabakiWassim Labaki
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2025-02-07 更新
浏览 38
基因组worse pulmonary symptomspotential therapeutic utilitygastroesophageal reflux diseasediv >< preflect shared etiologyidentified several ancestryoxidative stress signalingoxidative stress mechanismsindependent loci associated2 </ supcopd previously associatedoxidative stress
Genetic variants significantly associated (P<5E-06) with COPD in combined AA populations from TOPMed (COPDGene and SPIROMICS)

基本信息

模态
基因组
大小
0.000076968 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-02-07
版本
v1

资源简介

慢性阻塞性肺疾病遗传变异数据集(来自TOPMed的COPDGene和SPIROMICS联合AA人群)

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Genetic variants significantly associated (P<5E-06) with COPD in combined AA populations from TOPMed (COPDGene and SPIROMICS).》。配套论文《Novel risk loci encompassing genes influencing STAT3, GPCR, and oxidative stress signaling are associated with co-morbid GERD and COPD》发表于 PLOS Genetics(2025),DOI:10.1371/journal.pgen.1011531。源站首次发布:2025-02-07。

【数据内容】

源站原始描述:Abbreviations: COPD—Chronic Obstructive Pulmonary Disease; LL—95% Confidence Interval Lower Limit; MAF—Minor Allele Frequency; NHW—Non-Hispanic White; OR—Odds Ratio. (XLSX)

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 76.97 KB。pgen.1011531.s011.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,76.97 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pgen.1011531.s011。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:worse pulmonary symptoms、potential therapeutic utility、gastroesophageal reflux disease、div >< p、reflect shared etiology、identified several ancestry、oxidative stress signaling、oxidative stress mechanisms、independent loci associated、2 </ sup。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Genetic_variants_significantly_associated_P_5E-06_with_COPD_in_combined_AA_populations_from_TOPMed_COPDGene_and_SPIROMICS_/28372097

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wilson, Ava C.; Rocco, Alison; Chiles, Joe; Srinivasasainagendra, Vinodh; Labaki, Wassim; Meyers, Deborah; et al. (2025). Genetic variants significantly associated (P<5E-06) with COPD in combined AA populations from TOPMed (COPDGene and SPIROMICS).. PLOS Genetics. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "pgen.1011531.s011.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/52207331"

文件清单

  • pgen.1011531.s011.xlsx(76.97 KB)

文件总体积 76.97 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Abbreviations: COPD—Chronic Obstructive Pulmonary Disease; LL—95% Confidence Interval Lower Limit; MAF—Minor Allele Frequency; NHW—Non-Hispanic White; OR—Odds Ratio.
(XLSX)

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pgen.1011531.s011(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Genetic_variants_significantly_associated_P_5E-06_with_COPD_in_combined_AA_populations_from_TOPMed_COPDGene_and_SPIROMICS_/28372097)。

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