嗜酸性食管炎食管微生物组数据集
该数据集包含通过食管线试验收集的食管黏膜分泌物样本,涵盖细菌负荷(定量PCR数据)和细菌群落组成(16S rRNA测序数据)等多模态生物信息,主要用于研究嗜酸性食管炎、胃食管反流病等炎症性疾病与食管微生物组之间的关联,为探索微生物在食管病理机制中的作用提供关键数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集是一项前瞻性研究,旨在探究嗜酸性食管炎(EoE)患者的食管微生物组特征及其与疾病的关系。研究通过食管线试验(EST)收集了儿童和成人EoE患者、胃食管反流病(GERD)患者以及正常对照者的食管黏膜分泌物样本。数据内容包括细菌负荷(通过定量PCR测定)和细菌群落组成(通过16S rRNA基因扩增和454焦磷酸测序分析)。研究发现,EoE和GERD患者的细菌负荷均高于正常对照;未治疗的EoE患者中嗜血杆菌属显著增加,而接受质子泵抑制剂治疗的GERD患者中链球菌属减少。该数据集主要用于研究黏膜炎症性疾病(特别是EoE)与食管微生物组之间的关联,为理解微生物在食管炎症中的作用机制提供数据支持。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
源站:https://figshare.com/articles/dataset/_Esophageal_Microbiome_in_Eosinophilic_Esophagitis_/1429936
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数据说明
该数据集是一项前瞻性研究,旨在探究嗜酸性食管炎(EoE)患者的食管微生物组特征及其与疾病的关系。研究通过食管线试验(EST)收集了儿童和成人EoE患者、胃食管反流病(GERD)患者以及正常对照者的食管黏膜分泌物样本。数据内容包括细菌负荷(通过定量PCR测定)和细菌群落组成(通过16S rRNA基因扩增和454焦磷酸测序分析)。研究发现,EoE和GERD患者的细菌负荷均高于正常对照;未治疗的EoE患者中嗜血杆菌属显著增加,而接受质子泵抑制剂治疗的GERD患者中链球菌属减少。该数据集主要用于研究黏膜炎症性疾病(特别是EoE)与食管微生物组之间的关联,为理解微生物在食管炎症中的作用机制提供数据支持。
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