嗜酸性食管炎食管微生物组数据集
该数据集包含通过食管线试验收集的食管黏膜分泌物样本，涵盖细菌负荷（定量PCR数据）和细菌群落组成（16S rRNA测序数据）等多模态生物信息，主要用于研究嗜酸性食管炎、胃食管反流病等炎症性疾病与食管微生物组之间的关联，为探索微生物在食管病理机制中的作用提供关键数据支持。
基本信息
资源简介
嗜酸性食管炎食管微生物组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Esophageal Microbiome in Eosinophilic Esophagitis》。配套论文《Esophageal Microbiome in Eosinophilic Esophagitis》发表于 PLOS ONE（2015），DOI：10.1371/journal.pone.0128346。源站首次发布：2015-05-28。
【数据内容】
源站原始描述：Objective The microbiome has been implicated in the pathogenesis of a number of allergic and inflammatory diseases. The mucosa affected by eosinophilic esophagitis (EoE) is composed of a stratified squamous epithelia and contains intraepithelial eosinophils. To date, no studies have identified the esophageal microbiome in patients with EoE or the impact of treatment on these organisms. The aim of this study was to identify the esophageal microbiome in EoE and determine whether treatments change…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 31.01 KB。S1_Table.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，15.85 KB。S2_Table.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，15.16 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0128346。
【主题与分类】
源站学科分类：Biological Sciences、Ecology。主题标签：gastroesophageal reflux disease、pcr、Esophageal String Test、subject、gerd、16 S rRNA gene amplification、est、Bacterial load、esophageal microbiome、mucosal eosinophilia。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences、Ecology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Esophageal_Microbiome_in_Eosinophilic_Esophagitis_/1429936
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Harris, J. Kirk; Fang, Rui; D. Wagner, Brandie; Na Choe, Ha; J. Kelly, Caleb; Schroeder, Shauna; et al. (2016). Esophageal Microbiome in Eosinophilic Esophagitis. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/_Esophageal_Microbiome_in_Eosinophilic_Esophagitis_/1429936
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数据说明
该数据集是一项前瞻性研究，旨在探究嗜酸性食管炎（EoE）患者的食管微生物组特征及其与疾病的关系。研究通过食管线试验（EST）收集了儿童和成人EoE患者、胃食管反流病（GERD）患者以及正常对照者的食管黏膜分泌物样本。数据内容包括细菌负荷（通过定量PCR测定）和细菌群落组成（通过16S rRNA基因扩增和454焦磷酸测序分析）。研究发现，EoE和GERD患者的细菌负荷均高于正常对照；未治疗的EoE患者中嗜血杆菌属显著增加，而接受质子泵抑制剂治疗的GERD患者中链球菌属减少。该数据集主要用于研究黏膜炎症性疾病（特别是EoE）与食管微生物组之间的关联，为理解微生物在食管炎症中的作用机制提供数据支持。
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