大鼠反流性食管炎模型食管菌群16S rRNA测序及顺胃降逆汤干预数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1439181

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自反流性食管炎(RE)模型大鼠食管组织样本的原始16S rRNA基因测序数据。本研究旨在探究RE引起的食管微生物群组成变化，并评估顺胃降逆汤(SWJN)——一种改良中药方剂的调节作用。雄性Wistar大鼠分为四组：正常对照组(Control)、RE模型组(Mod)、SWJN低剂量组(SWJN_L)和SWJN高剂量组(SWJN_H)。治疗4周后收集食管样本。对16S rRNA基因的V3-V4高变区进行扩增，并在Illumina NovaSeq 6000平台上测序。这些数据为食管微生物群在RE发病机制中的作用及SWJN的治疗机制提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。