REMBRANDT：牙种植体抗生素使用后微生物组恢复研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05622721

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数据说明

状况：菌群失调、艰难梭菌、宠物与人类纽带、抗生素相关性结肠炎。艰难梭菌感染（CDI）是医疗保健相关感染性腹泻最常见的原因之一，并导致显著的发病率和死亡率。CDI发生于原生肠道微生物组被破坏时，最常见于抗菌治疗后，随之而来的菌群失调导致微生物多样性下降、某些细菌类群丰度变化以及对艰难梭菌定植抵抗力的丧失。恢复“功能完整”的肠道微生物组对于清除艰难梭菌至关重要，恢复不充分可导致复发性CDI。肠道微生物组从菌群失调中恢复的机制尚知之甚少，与获得和重新获得对艰难梭菌提供定植抵抗力相关的因素也尚不明确。虽然动物宿主可作为致病菌的潜在来源，但申请人及其他研究者的研究发现，养宠物可预防艰难梭菌的定植和再感染。

此外，微生物群在宠物与其主人之间共享，且宠物的微生物组中含有可提供针对艰难梭菌定植抵抗的细菌分类群。基于这些数据，拟开展的研究将：1）检验以下假说，即观察到的养宠物所带来的保护效应是由于宠物与主人之间共享了可提供针对艰难梭菌定植抵抗的微生物群；2）确定宠物接触是否可减轻抗菌药物相关的肠道微生物组破坏并促进其恢复；3）评估宠物接触是否可降低抗菌药物治疗后艰难梭菌定植和感染的可能性。这将通过对因非肠道适应症（牙种植体）而接受预防性抗菌药物治疗的患者，在患者/宠物单元内对其肠道微生物组进行纵向采样来实现。该研究将进一步明确CDI的流行病学和病理生理学特征，这些特征可能

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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