PXD010827：Hsp70磷酸化位点遗传分析揭示其在白色念珠菌细胞与菌落形态发生中的作用

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010827

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数据说明

热休克蛋白最为人所知的是其作为伴侣蛋白参与一般蛋白质稳态的作用，但它们也能参与特定的细胞调控途径，例如通过其翻译后修饰。Hsp70/Ssa1是真核生物中一种核心的胞质伴侣蛋白，它还通过其在特定残基上的磷酸化参与细胞周期调控。在此，我们分析了Ssa1磷酸化在真菌白色念珠菌形态发生中的作用，白色念珠菌是一种常见的人类机会性病原体。白色念珠菌能够呈现酵母型和菌丝型（霉菌型）两种交替形态，这种能力有助于其致病性。我们在白色念珠菌Ssa1上鉴定出11个磷酸化位点，其中8个仅在菌丝细胞中检测到。对这些位点的遗传分析揭示了其对高温生长、细胞和菌落形态以及对细胞壁活性药物耐药性的等位基因特异性效应。这项分析可能有助于指导针对Ssa1特异性药物的筛选，以对抗白色念珠菌。

白色念珠菌的毒力。许多Ssa1突变的多效性效应与Ssa1客户蛋白的大量存在相一致，而不同等位基因表型之间缺乏一致性则表明，Ssa1上的不同位点可影响与特定类别客户蛋白的相互作用，并且这些位点的修饰可发挥细胞调节作用，这与“伴侣蛋白密码”假说相吻合。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。