PXD001247：免疫刺激后原代与永生化小鼠肝巨噬细胞的细胞及蛋白质组反应不同于单核细胞衍生巨噬细胞

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001247

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Kupffer细胞是肝脏抵御病原体的第一道防线，然而多种微生物仍能成功靶向肝脏，绕过免疫监视，并在该组织中有效发育。我们目前对Kupffer细胞-病原体相互作用的认识虽然有限，但主要是通过研究原代细胞获得的，而原代细胞需要从大量动物中分离。为促进Kupffer细胞生物学研究，建立了永生化大鼠Kupffer细胞系RKC1。我们对RKC1与原代大鼠Kupffer细胞(PRKC)进行了比较性全蛋白质组分析，以表征它们各自对脂多糖(LPS)介导的免疫刺激的应答。我们发现RKC1与PRKC对LPS的蛋白质组应答谱存在明显差异。我们观察到，刺激后PRKC上调了更多免疫功能通路，并表现出细胞形态的显著变化。因此，鉴于已知巨噬细胞会响应病原体而诱导细胞骨架变化，我们分析了这些细胞的细胞骨架信号通路。我们的研究结果提示，Kupffer细胞对炎症刺激的应答不同于单核细胞来源的巨噬细胞，这些数据可能为了解病原体（如疟原虫）如何进化出通过Kupffer细胞进入肝脏而不被检测到的机制提供线索。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。